Journals / İstanbul Tıp Fakültesi Dergisi / 2020 / Cilt: 83 - Sayı: 1

MAGNETIC RESONANCE IMAGING BASED FUNCTIONAL CONNECTIVITY METHODS

MANYETİK REZONANS GÖRÜNTÜLEME TEMELLİ FONKSİYONEL BAĞLANTISALLIK YÖNTEMLERİ

Pages
71–80
Publication Date
2020-01-13
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

There are alternative functional connectivity estimation approaches, which, despite the similarity of the overall results, produce significant differences in their details.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Functional connectivity analyses based on functional Magnetic Resonance Imaging (fMRI) data have gained an important place in brain research.
📊
Key Findings & Data:There are alternative functional connectivity estimation approaches, which, despite the similarity of the overall results, produce significant differences in their details.
💡
Conclusion & Impact:In this review, functional connectivity estimation methods will be compared by evaluating them using these three perspectives.
🔬Design:Review & Systematic Survey
📍Scope:Comprehensive Sample
⚙️Variables:Fonksiyonel nörogörüntüleme · fonksiyonel bağlantısallık · entrensek bağlantısallık ağları

Abstract

Functional connectivity analyses based on functional Magnetic Resonance Imaging (fMRI) data have gained an important place in brain research. There are alternative functional connectivity estimation approaches, which, despite the similarity of the overall results, produce significant differences in their details. For effective use of the functional connectivity metrics, the strengths and weaknesses of various approaches need to be well understood. While the seed-based functional connectivity analyses based on the selection of those anatomic regions of interest derived from the literature represent a stronger approach for hypothesis testing, the independent component analysis (ICA) as a data-driven approach provides an unbiased evaluation possibility for exploratory data analysis. Another difference between the methods is related to group analyses in terms of registering individual brains to a common template or implementing anatomical definitions on the spatial coordinates of individual brains. While the latter increases the success in studies on pathologies that lead to large-scale brain deformations, the former may be advantageous for deriving normative results from large data sets. Lastly, volume vs surface-based approaches for the definition of cortical anatomy in the individual space also significantly affect the results of functional connectivity analyses. In this review, functional connectivity estimation methods will be compared by evaluating them using these three perspectives.

Özet

Fonksiyonel Manyetik Rezonans Görüntüleme (fMRG) verilerine dayanan fonksiyonel bağlantısallık analizleri beyin araştırmalarında önemli bir yer kazanmıştır. Özellikle dinlenim durumunda beynin büyük ölçekli nörokognitif ağlarının ortaya koyulabilmesi ve bunların hastalıklardaki değişimlerinin gösterilebilmesi bu araştırma yöntemine olan ilgiyi artırmıştır. Öte yandan, genel hatlarıyla birbirine benzer olsa da detayda farklılaşan sonuçlar üreten alternatif fonksiyonel bağlantısallık hesaplama yaklaşımları mevcuttur. Fonksiyonel nörogörüntülemenin etkin kullanımı için bu farklı yaklaşımların, ele alınan problem ve incelenen popülasyona bağlı olarak beynin büyük ölçekli ağlarının yapısal örüntülerini ve işlevlerini ortaya koymaktaki güçlü ve zayıf yönlerinin anlaşılması gereklidir. Bu çerçevede, hipotez testi için literatürden kaynaklı anatomik ilgi alanlarının seçimine dayanan tohum temelli fonksiyonel bağlantısallık analizi daha güçlü bir yaklaşımken, keşifçi araştırmalarda tümüyle veri güdümlü olan bağımsız bileşen analizi (BBA) tüm beyin verisini tarafsız değerlendirme olanağı sunmaktadır. Yöntemler arasındaki diğer önemli ayrım, grup analizleri için incelenen beyinlerin anatomik olarak ortak bir şablon üzerinde çakıştırılması veya anatomik tanımlamaların her beynin kendi mekânsal koordinatlarında gerçekleştirilmesidir. Beyinde büyük ölçekli deformasyonlara yol açan patolojilerde ikinci yolun seçimi başarımı büyük ölçüde arttırırken, büyük ölçekli sağlıklı katılımcı veri kümelerinden normatif sonuçlar çıkartmak için ilk yaklaşım daha avantajlı olabilir. Son olarak, bireysel koordinatlarda kortekse ilişkin anatomik tanımlamaların gerçekleştirilmesinde hacim veya yüzeye dayalı yaklaşımlar da fonksiyonel bağlantısallık çalışmalarının sonuçlarını önemli ölçüde etkilemektedir. Bu derlemede, fonksiyonel bağlantısallık hesaplama yaklaşımları bu üç perspektiften ele alınarak karşılaştırılacaktır.

🔖

Cite This Article

HARI, E., AY, U., NEŞE, H., BAYRAM, A., DEMİRALP, T. (2020). MAGNETIC RESONANCE IMAGING BASED FUNCTIONAL CONNECTIVITY METHODS. İstanbul Tıp Fakültesi Dergisi, Cilt: 83 - Sayı: 1, 71–80. https://ajindex.com/articles/92933

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (15)

  1. Bijsterbosch J, Smith SM, Beckmann C. Introduction to Resting State FMRI Functional Connectivity. Oxford University Press, 2017
  2. Beckmann CF, Deluca M, Devlin JT, Smith SM. Investigations into resting-state connectivity using independent component analysis. Philos Trans R Soc Lond, B, Biol Sci 2005;360(1457):1001-13
  3. Leopold DA, Maier A. Ongoing physiological processes in the cerebral cortex. Neuroimage 2012;62(4):2190-200
  4. Greicius MD, Krasnow B, Reiss AL, Menon V. Functional connectivity in the resting brain: a network analysis of the default mode hypothesis. Proc Natl Acad Sci USA 2003;100(1):253-8
  5. Fox MD, Raichle ME. Spontaneous fluctuations in brain activity observed with functional magnetic resonance imaging. Nat Rev Neurosci 2007;8(9):700-11
  6. Raichle ME, Macleod AM, Snyder AZ, Powers WJ, Gusnard DA, Shulman GL. A default mode of brain function. Proc Natl Acad Sci USA 2001;98(2):676-82
  7. Biswal B, Yetkin FZ, Haughton VM, Hyde JS. Functional connectivity in the motor cortex of resting human brain using echo-planar MRI. Magn Reson Med 1995;34(4):53741
  8. Damoiseaux JS, Rombouts SA, Barkhof F, Scheltens P, Stam CJ, Smith SM, et al. Consistent resting-state networks across healthy subjects. Proc Natl Acad Sci USA 2006;103(37):13848-53
  9. Schmidt SA, Akrofi K, Carpenter-thompson JR, Husain FT. Default mode, dorsal attention and auditory resting state networks exhibit differential functional connectivity in tinnitus and hearing loss. PLoS ONE 2013;8(10):e76488
  10. Fransson P, Marrelec G. The precuneus/posterior cingulate cortex plays a pivotal role in the default mode network: Evidence from a partial correlation network analysis. Neuroimage 2008;42(3):1178-84
  11. Critchley HD, Wiens S, Rotshtein P, Ohman A, Dolan RJ. Neural systems supporting interoceptive awareness. Nat Neurosci 2004;7(2):189-95
  12. Corbetta M, Shulman GL. Control of goal-directed and stimulus-driven attention in the brain. Nat Rev Neurosci 2002;3(3):201-15
  13. Menon V, Adleman NE, White CD, Glover GH, Reiss AL. Error-related brain activation during a Go/NoGo response inhibition task. Hum Brain Mapp 2001;12(3):131-43
  14. Andrews-hanna JR, Reidler JS, Sepulcre J, Poulin R, Buckner RL. Functional-anatomic fractionation of the brain’s default network. Neuron 2010;65(4):550-62.15. Toga AW, Clark KA, Thompson PM, Shattuck DW, Van horn JD. Mapping the human connectome. Neurosurgery 2012;71(1):1-5
  15. Vossel S, Geng JJ, Fink GR. Dorsal and ventral attention systems: