SavedAdd your journal

Journals / Osmaniye Korkut Ata Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi / 2020 / Cilt: 3 Sayı: 2

Isolation of Thermostable Alpha-amylase Producing Mesophilic Bacterium and Partial Characterization of the Enzyme

Sıcaklığa Dirençli Alfa-amilaz Enzimi Üreten Mezofilik Bakteri İzolasyonu ve Enzimin Kısmi Karakterizasyonu

Gültekin Özdemir(OSMANİYE KORKUT ATA ÜNİVERSİTESİ, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, BİYOLOJİ (YL))0000-0002-4151-5399
B. Devrim Özcan(ÇUKUROVA ÜNİVERSİTESİ, ZİRAAT FAKÜLTESİ, ZOOTEKNİ BÖLÜMÜ)0000-0002-9198-656X
Pages
146–153
Publication Date
2020-12-15
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

İzolatın CFX, CN, TE, RD, S, Amp ve P antibiyotiklerine karşı hassas, SH antibiyotiğine ise dirençli olduğu gözlenmiştir.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Bu çalışmada, Niğde ili Ulukışla ilçesi Çiftehan bölgesi sınırları içinde bulunan kaplıcadan alınan toprak örneklerinden α-amilaz aktivitesine sahip Bacillus izolasyonu yapılmıştır.
📊
Key Findings & Data:GA4 olarak isimlendirilmiştir.
💡
Conclusion & Impact:İzolatın CFX, CN, TE, RD, S, Amp ve P antibiyotiklerine karşı hassas, SH antibiyotiğine ise dirençli olduğu gözlenmiştir.
🔬Design:Research Article
📍Scope:Comprehensive Sample
⚙️Variables:Mezofilik Bacillus · İzolasyon · Alfa-amilaz

Özet

Bu çalışmada, Niğde ili Ulukışla ilçesi Çiftehan bölgesi sınırları içinde bulunan kaplıcadan alınan toprak örneklerinden α-amilaz aktivitesine sahip Bacillus izolasyonu yapılmıştır. İzolat bakteri, Bacillus sp. GA4 olarak isimlendirilmiştir. Bacillus sp. GA4 izolatına ait α-amilaz enziminin optimum pH ve sıcaklık değerleri sırasıyla 6.0-8.0 ve 50 ºC olarak bulunmuştur. Enzim 40 ºC’de 30 dk. ön inkübasyon sonrasında aktivitesini tamamen korumuştur. Enzim, 50 ºC ve 60 ºC’de 30 dk. ön inkübasyon sonrasında ise sırasıyla %21 ve %37’lik aktivite kaybına uğramıştır. MgCl2 ve FeSO4 enzim aktivitesini sırasıyla %13 ve %12 seviyelerinde artırırken, CuSO4, CaCl2 ve EDTA sırasıyla %81, %38 ve %33 oranlarında inhibe etmiştir. Bacillus sp. GA4 α-amilaz enziminin moleküler ağırlığı SDS-PAGE zimogram analizi ile yaklaşık olarak 55 kDa bulunmuştur. İzolatın CFX, CN, TE, RD, S, Amp ve P antibiyotiklerine karşı hassas, SH antibiyotiğine ise dirençli olduğu gözlenmiştir.

🔖

Cite This Article

Özdemir, G., Özcan, B. D. (2020). Isolation of Thermostable Alpha-amylase Producing Mesophilic Bacterium and Partial Characterization of the Enzyme. Osmaniye Korkut Ata Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, Cilt: 3 Sayı: 2, 146–153. https://doi.org/10.47495/okufbed.824607

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (31)

  1. Referans1 Karademir G., Karademir B. Yem katkı maddesi olarak kullanılan biyoteknolojik ürünler, Lalahan Hayvancılık Araştırma Enstitüsü Dergisi 2003; 43(1): 61-74, 2003.
  2. Referans2 Nelson DL., Cox MM. Lehninger principles of biochemistry, Chapter 6, W.H. Freeman and Company, 4th Ed. New York, USA: 2004.
  3. Referans3 Gümüşel F. Biyoteknoloji, genetik ve sağlık sektörü, Kocaeli Sanayii İçin Teknolojik Uzgörü Ortak Projesi 2002; 73-135.
  4. Referans4 Wiseman A. The application of enzymes in industry. In: Horwood, E. (Ed.) Handbook of enzymes biotechnology. Chichester-UK 1987; 274-373.
  5. Referans5 Gupta R., Gigras P., Mohapatra H., Goswami VK., Chauhan B. Microbial α-amylases: a biotechnological perspective, Process Biochemistry 2003; 38(11):1599-1616.
  6. Referans6 Robyt JF. Enzymes and their action on starch. In: BeMiller, J., Whistler, R. (Eds.) Starch, chemistry and technology. Academic Press, New York: 2009; 237–292.
  7. Referans7 Whitehurst RJ. Van Oort M. Enzymes in food tehcnology. In: Whitehurst, RJ., Van Oort, M. (Eds.), 2nd Ed. Wiley-Blackwell, Chichester, England: 2009.
  8. Referans8 Leveque E., Janecek S., Haye B., Belarbi A. Thermophilic archaeal amylolytic enzymes-catalytic mechanism, substrate specificity and stability, Enyzme and Microbial Technology 2000; 26: 3-14.
  9. Referans9 Asgher M., Asad MJ., Rahman SU., Legge RL. A thermostable α-amylase from a moderately thermophilic Bacillus subtilis strain for starch processing. Journal of Food Engineering 2007; 79(3): 950-955.
  10. Referans10 Hewitt CJ., Solomons GL. The production of α-amylase (E.C.3.2.1.1.) by Bacillus amyloliquefaciens, in a complex and a totally defined synthetic culture medium. Journal of Industrial Microbiology 1996; 17(2): 96-99.
  11. Referans11 Godfrey T., West S. Introduction to industrial enzymology. In: Godfrey, T., West, S. (Eds) New York, USA: Stockton Press 1996.
  12. Referans12 Canoğulları S. Etlik piliç karma yemlerinde enzim kullanımı ve kullanım koşulları, Doktora Tezi, Çukurova Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü, Adana, Türkiye, 1999.
  13. Referans13 Lennete EH., Ballows A., Hausler JW Jr., Shadomy JH. Manuel of clinical microbiology, American Society for Microbiology, Washington D.C., USA: 1985; 4:1149.
  14. Referans14 Demirkan S. Production, purification, and characterization of α-amylase by Bacillus subtilis and its mutant derivates, Turkish Journal of Biology 2011; 35:705-712.
  15. Referans15 Miller GL. Use of dinitrosalicylic acid reagent for determination of reducing sugar, Analytical Chemistry 1959; 426-428.
  16. Referans16 Burhan AI., Nisa U., Gokhan C., Omer C., Ashabil A., Osman G. Enzymatic properties of a novel thermostable, thermophilic, alkaline and chelator resistant amylase from an alkaliphilic Bacillus sp. isolate ANT-6, Process Biochemistry 2003; 38(10):1397–1403.
  17. Referans17 Laemmli UK. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of the bacteriophage T4, Nature 1970; 227: 680-685.
  18. Referans18 Ikeda T., Yamazaki H., Yamashita K., Shinke R. The tetracycline inducible expression of alpha-amylase in Bacillus subtilis. Journal of Fermentation and Bioengineering 1992; 74: 58-60.
  19. Referans19 Lee SP., Morikawa M., Takagi M., Imanaka T. Cloning of the aapT gene and characterization of its product, α-amylase-pullulanase (AapT), from thermophilic and alkaliphilic Bacillus sp. strain XAL601, Applied and Environmenatl Microbiology 1994; 60(10): 3764-3773.
  20. Referans20 Remize F. Spore-formin bacteria, The microbiological quality of food. In: Bevilacqua, A., Corbo, M.R., Sinigaglia, M. (Eds) Elsevier Ltd., Woodhead Publishing, Chennai, India, 2017.
  21. Referans21 Harwood CR. Bacillus subtilis and its relatives: Molecular biological and industrial workhorses, Elsevier Science Publishers Ltd. U.K: 1992; 10:247-256.
  22. Referans22 Vehmaanperä J. Development of Bacillus strains for industrial enzyme production by gene technology, Academic Dissertation in General Microbiology, PhD Thesis, Helsinki-Finland, 1990.
  23. Referans23 Özcan BD. Studies on cloning of thermostable amylase genes, Yüksek Lisans Tezi, Çukurova Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü, Adana, Türkiye, 2005.
  24. Referans24 Grootegoed JA., Lauwers AM., Heinen W. Separation and partial purification of extracellular amylase and protease from Bacillus caldolyticus, Archives of Microbiology 1973; 90:223.
  25. Referans25 Bano S., Qader SAU., Aman A., Syed MN., Azhar A. Purification and characterization of novel α-Amylase from Bacillus subtilis KIBGE HAS, AAPS PharmSciTech 2011; 12(1): 255–261.
  26. Referans26 Femi-Ola TO., Olowe BM. Characterization of alpha-amylase from Bacillus subtilis BS5 isolated from Amitermes evuncifer Silvestri, Research Journal of Microbiology 2011; 6(2):140-146.
  27. Referans27 Ratanakhanokchai K., Kaneko J., Kamio Y., Izaki K. Purification and properties of a maltotetraose and maltotriose producing amylase from Chloroflexus aurantiacus, Applied and Environmental Microbiology 1992; 58:2490–2494.
  28. Referans28 Matzke J., Schwermann B., Baker EP. Acidostable and acidophilic proteins: the example of the α-amylase from Alicyclobacillus acidocaldarius, Comparative Biochemistry and Physiology Part A: Physiology 1997; 118:475-479.
  29. Referans29 Bozic N., Ruiz J., Lopez-Santin J., Vujcic V. Production and properties of the highly efficient raw starch digesting α-amylase from a Bacillus licheniformis ATCC 9945a, Biochemical Engineering Journal 2011; 53:203–209.
  30. Referans30 Aguilar GJ., Morlon-Guyot B., Trejo-Aguilar C., Guyot JP. Purification and characterization of an extracellular α-amylase produced by Lactobacillus manihotivorans LMG 18010T an amylolytic lactic acid bacterium, Enzyme and Microbial Technology 2000; 27: 406–413.
  31. Referans31 Liu XD., Xu Y. A novel raw starch digesting α-amylase from a newly isolated Bacillus sp. YX-1: Purification and characterization, Bioresource Technology 2008; 99: 4315-4320.