SavedAdd your journal

Journals / Journal of Anatolian Environmental and Animal Sciences / 2021 / Cilt: 6 - Sayı: 3

Metagenomic characterization of planktonic communities during a mucilage event in the Çanakkale Strait (Dardanelles), Turkey

Çanakkale Boğazı'nda (Dardanel) Müsilaj Oluşumu Sırasında Planktonik Toplulukların Metagenomik Karakterizasyonu

Sevdan YILMAZ
Mehmet Ali KÜÇÜKER
Dilek KAHRAMAN
Pages
421–427
Publication Date
2021-09-28
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

Bu nedenle deniz yüzeyinden toplanan müsilajın düzenli depolama sahalarına gönderilmeden önce ağır metal içeriği kontrol edilmelidir.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Bu çalışma da Çanakkale Boğazı'ında (Dardanel) müsilaj oluşumu sırasında planktonik toplulukların kompozisyonları metagenomik yaklaşımla araştırılmıştır.
📊
Key Findings & Data:Müsilaj örnekleri, Çanakkale Boğazı'nın üç farklı istasyonunda (İstasyon 1: 40°15'22.53"K, 26°40'43.58"D; İstasyon 2: 40°10'59.21"K 26°37'81.17"D; İstasyon 3: 40°11'15.67"K, 26°39'90.81"D) yoğun müsilaj oluşumu gözlemlenen Mayıs 2021'de toplanmıştır.
💡
Conclusion & Impact:Bu nedenle deniz yüzeyinden toplanan müsilajın düzenli depolama sahalarına gönderilmeden önce ağır metal içeriği kontrol edilmelidir.
🔬Design:Lab & Field Experiment
📍Scope:2021 Verileri
⚙️Variables:Metagenomik dizileme · müsilaj · ökaryotik biyoçeşitlilik

Abstract

Bu çalışma da Çanakkale Boğazı'ında (Dardanel) müsilaj oluşumu sırasında planktonik toplulukların kompozisyonları metagenomik yaklaşımla araştırılmıştır. Müsilaj örnekleri, Çanakkale Boğazı'nın üç farklı istasyonunda (İstasyon 1: 40°15'22.53"K, 26°40'43.58"D; İstasyon 2: 40°10'59.21"K 26°37'81.17"D; İstasyon 3: 40°11'15.67"K, 26°39'90.81"D) yoğun müsilaj oluşumu gözlemlenen Mayıs 2021'de toplanmıştır. Filum düzeyinde toplam sekans sayısının 86.68% ini kapsayan baskın planktonik ökaryotlar, Dinoflagellata (%38.57), Protalveolata (%15.03), Diatomea (%12.41), Nematozoa (%8.44), Apicomplexa (%6.79) ve Chlorophyta (%5.43) olarak belirlenmiştir. En baskın OTU'ler (>%10), Alexandrium ve Syndiniales_Group_II olup, diğer baskın OTU'lar (>%2) ise Viscosia sp., Lankesteria, Arcocellulus, Thalassiosira ve Nannochloris olmuştur. Bu çalışma, Türkiye'de meydana gelen bir müsilaj olayı sırasında Çanakkale Boğazı'nda planktonik toplulukların durumunu netleştirmiştir. Sonuç olarak, en baskın cinsin müsilaj üretme kabiliyeti olduğu bilinen Alexandrium olduğu belirlenmiştir. Bazı Alexandrium türleri toksin üretebilir, insan sağlığı üzerinde ciddi etkilere neden olabilir ve çift kabuklu, karides ve balık ölümlerine yol açabilir. Bu nedenle müsilaj yapısındaki Alexandrium toksinlerinin belirlenmesi için daha detaylı bir çalışmaya ihtiyaç vardır. Ayrıca elde edilen müsilajın ağır metal içeriği araştırılmıştır. Müsilajın yapısındaki As ve Cr konsantrasyonları atıklar için belirlenen düzenli depolama sahalarına bertaraf etme sınırlarının üzerindedir. Bu nedenle deniz yüzeyinden toplanan müsilajın düzenli depolama sahalarına gönderilmeden önce ağır metal içeriği kontrol edilmelidir.

Özet

Bu çalışma da Çanakkale Boğazı'ında (Dardanel) müsilaj oluşumu sırasında planktonik toplulukların kompozisyonları metagenomik yaklaşımla araştırılmıştır. Müsilaj örnekleri, Çanakkale Boğazı'nın üç farklı istasyonunda (İstasyon 1: 40°15'22.53"K, 26°40'43.58"D; İstasyon 2: 40°10'59.21"K 26°37'81.17"D; İstasyon 3: 40°11'15.67"K, 26°39'90.81"D) yoğun müsilaj oluşumu gözlemlenen Mayıs 2021'de toplanmıştır. Filum düzeyinde toplam sekans sayısının 86.68% ini kapsayan baskın planktonik ökaryotlar, Dinoflagellata (%38.57), Protalveolata (%15.03), Diatomea (%12.41), Nematozoa (%8.44), Apicomplexa (%6.79) ve Chlorophyta (%5.43) olarak belirlenmiştir. En baskın OTU'ler (>%10), Alexandrium ve Syndiniales_Group_II olup, diğer baskın OTU'lar (>%2) ise Viscosia sp., Lankesteria, Arcocellulus, Thalassiosira ve Nannochloris olmuştur. Bu çalışma, Türkiye'de meydana gelen bir müsilaj olayı sırasında Çanakkale Boğazı'nda planktonik toplulukların durumunu netleştirmiştir. Sonuç olarak, en baskın cinsin müsilaj üretme kabiliyeti olduğu bilinen Alexandrium olduğu belirlenmiştir. Bazı Alexandrium türleri toksin üretebilir, insan sağlığı üzerinde ciddi etkilere neden olabilir ve çift kabuklu, karides ve balık ölümlerine yol açabilir. Bu nedenle müsilaj yapısındaki Alexandrium toksinlerinin belirlenmesi için daha detaylı bir çalışmaya ihtiyaç vardır. Ayrıca elde edilen müsilajın ağır metal içeriği araştırılmıştır. Müsilajın yapısındaki As ve Cr konsantrasyonları atıklar için belirlenen düzenli depolama sahalarına bertaraf etme sınırlarının üzerindedir. Bu nedenle deniz yüzeyinden toplanan müsilajın düzenli depolama sahalarına gönderilmeden önce ağır metal içeriği kontrol edilmelidir.

🔖

Cite This Article

YILMAZ, S., KÜÇÜKER, M. A., KAHRAMAN, D. (2021). Metagenomic characterization of planktonic communities during a mucilage event in the Çanakkale Strait (Dardanelles), Turkey. Journal of Anatolian Environmental and Animal Sciences, Cilt: 6 - Sayı: 3, 421–427. https://ajindex.com/articles/773588

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (9)

  1. Aktan, Y., & Topaloğlu, B. (2011). First record of Chrysophaeum taylorii Lewis & Bryan and their benthic mucilaginous aggregates in the Aegean Sea (Eastern Mediterranean). Journal of the Black Sea / Mediterranean Environment, 17(2), 159-170.
  2. Artüz, M. L., Okay, I. A., Mater, B., Artüz, O. B., Gürseler, G., & Okay, N. (2007). Bilimsel Açıdan Marmara Denizi. Istanbul: Union of Turkish Bar Associations publication. Aydın, H., & Uzar, S. (2013). Some potentially toxic dinoflagellate cysts in recent sediments from İzmir Bay. Su Ürünleri Dergisi, 30(3), 109-114.
  3. Aydın, H., Matsuoka, K., & Minareci, E. (2011). Distribution of dinoflagellate cysts in recent sediments from Izmir Bay (Aegean Sea, Eastern Mediterranean). Marine Micropaleontology, 80(1-2), 44-52.
  4. Balkis, N. (2004). List of phytoplankton of Sea of Marmara. Journal of the Black Sea / Mediterranean Environment, 10, 123-141 (2004).
  5. Balkis, N., & Taş, S. (2016). Phytoplankton of the Sea of Marmara: A review. In: Yücel, M., Özkan, K., & Tezcan, D. (Eds.,). The sea of Marmara marine biodiversity fisheries conservation and governance. 1st ed., 326-343p, Turkish marine research foundation (TUDAV) Publication, Turkey. Balkis, N., Atabay, H., Türetgen, I., Albayrak, S., Balkis, H., & Tüfekçi, V. (2011). Role of single-celled organisms in mucilage formation on the shores of Buyukada Island (the Marmara Sea). Marine Biological Association of the United Kingdom. Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom, 91(4), 771. Balkis, N., Balci, M., Giannakourou, A., Venetsanopoulou, A., & Mudie, P. (2016). Dinoflagellate resting cysts in recent marine sediments from the Gulf of Gemlik (Marmara Sea, Turkey) and seasonal harmful algal blooms. Phycologia, 55(2), 187-209.
  6. Callahan, B. J., McMurdie, P. J., Rosen, M. J., Han, A. W., Johnson, A. J. A., & Holmes, S. P. (2016). DADA2: high-resolution sample inference from Illumina amplicon data. Nature methods, 13(7), 581-583.
  7. Chambouvet, A., Morin, P., Marie, D., & Guillou, L. (2008). Control of toxic marine dinoflagellate blooms by serial parasitic killers. Science, 322(5905), 1254-1257.
  8. Clarke, L. J., Bestley, S., Bissett, A., & Deagle, B. E. (2019). A globally distributed Syndiniales parasite dominates the Southern Ocean micro-eukaryote community near the sea-ice edge. The ISME journal, 13(3), 734-737.
  9. Coats, D. W., & Park, M. G. (2002). Parasitism of photosynthetic dinoflagellates by three strains of Amoebophrya (Dinophyta): Parasite survival, infectivit