Journals / Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi / 2022 / Cilt: 79 - Sayı: 2

Evaluation of Clostridium difficile Toxin B results by polymerase chain reaction from stool specimens

Dışkı örneklerinden polimeraz zincir reaksiyonu ile saptanan Clostridium difficile Toksin B sonuçlarının değerlendirilmesi

Pages
209–216
Publication Date
2022-11-06
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

It was found 109 from stool samples. 9 (8%), C. difficile PCR test toxin B positive, 100 (92%) negative.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Objective: Clostridium difficile is a Gram-positive, anaerobic, spore-forming bacterium that spreads via the fecal-oral route and causes asymptomatic carriage or mild diarrheal diseases such as pseudomembranous enterocolitis.
📊
Key Findings & Data:Methods: 109 fecal samples that came to our laboratory between January 2017 and September 2018 on suspicion of C. difficile infection were tested with the GeneXpert C. difficile PCR (Cepheid, CA, AD) method.
💡
Conclusion & Impact:It was found 109 from stool samples. 9 (8%), C. difficile PCR test toxin B positive, 100 (92%) negative.
🔬Design:Research Article
📍Scope:2017 · 109 samples
⚙️Variables:Domain Parameters

Abstract

Objective: Clostridium difficile is a Gram-positive, anaerobic, spore-forming bacterium that spreads via the fecal-oral route and causes asymptomatic carriage or mild diarrheal diseases such as pseudomembranous enterocolitis. C. difficile is the commonest cause of nosocomial and antibiotic-associated diarrhea in North America and Europe. It can produce two toxins called A and B. Strains producing toxins can lead to a more serious disease picture that causes megacolon, perforation or septic shock. The use of molecular methods with high specificity and sensitivity has become widespread in recent years.The use of molecular methods with high specificity and sensitivity, which are easier to apply in diagnosis, and to obtain rapid results, has become widespread in recent years. In this study, it was aimed to evaluate C. difficile results determined by polymerase chain reaction (PCR) from stool samples. Methods: 109 fecal samples that came to our laboratory between January 2017 and September 2018 on suspicion of C. difficile infection were tested with the GeneXpert C. difficile PCR (Cepheid, CA, AD) method. The data obtained are interpreted as positive, negative or invalid results. Results: A total of 109 samples were tested. 66 (61%) of the stool samples belonged to male and 43 (39%) female patients. Twenty-five (23%) of the patients were under the age of 18 and 36 (33%) under the age of 18 years. Of the samples, 26 (24%) were from intensive care units, 60 (55%) were from services and 23 (21%) were from polyclinics. It was found 109 from stool samples. 9 (8%), C. difficile PCR test toxin B positive, 100 (92%) negative. Conclusion: The most important cause of nosocomial diarrhea is C. difficile. The main predisposing factor of infection is the use of antibiotics. Prophylaxis or even one dose of antibiotic therapy may be sufficient for the development of C. difficile infection. Rapid and accurate diagnosis by PCR is important for early initiation of treatment.

Özet

Amaç: Clostridium difficile, fekal-oral yolla yayılan Gram-pozitif, anaerop, spor oluşturan bir bakteridir. Asemptomatik taşıyıcılık veya hafif diyareden psödomembranöz enterokolit gibi hayatı tehdit eden hastalıklara kadar çeşitli klinik tablolara neden olur. C. difficile, Amerika’da ve Avrupa’da antibiyotikle ilişkili ishale neden olan hastane enfeksiyonunun en yaygın nedenidir. A ve B olarak isimlendirilen iki toksin üretebilir. Toksin üreten suşlar megakolon, perforasyon veya septik şoka neden olan daha ciddi hastalık tablosuna yol açabilmektedir. Tanıda uygulaması daha kolay, hızlı sonuç elde edebileceğimiz, yüksek özgüllük ve duyarlılığa sahip moleküler yöntemlerin kullanılması son yıllarda yaygınlaşmaya başlamıştır. Bu çalışmada dışkı örneklerinden polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile saptanan C. difficile sonuçlarının retrospektif olarak değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Yöntem: Laboratuvarımıza C. difficile enfeksiyonu şüphesiyle Ocak 2017 ile Eylül 2018 tarihleri arasında gelen 109 dışkı örneği GeneXpert C. difficile PZR (Cepheid, CA, AD) yöntemi ile test edilmiştir. Elde edilen veriler pozitif, negatif veya geçersiz sonuç olarak yorumlanmışır. Bulgular: Toplam 109 örnek test edilmiştir. Dışkı örneklerinin 66 (% 61)’sı erkek, 43 (%39)‘ü kadın hastalara aittir. Örnek istenen hastaların 25 (%23)’i 65 yaş üstü 36 (%33)’sı 18 yaşın altındaydı. Gelen örneklerin 26 (%24)’sı yoğun bakım ünitelerinden, 60 (%55)’ı servislerden ve 23 (%21)’ü polikliniklerden laboratuvarımıza gelmiştir. 109 dışkı örneğinden 9 (%8)’u C. difficile PZR testiyle toksin B pozitif, 100 (%92)’ü negatif bulunmuştur. Sonuç: Nozokomiyal diyarelerin en önemli nedeni C. difficile’dir. Enfeksiyonun temel predispozan faktörü antibiyotik kullanımıdır. Profilaksi veya tedavi amacıyla bir doz bile olsa antibiyotik kullanılması C. difficile enfeksiyonu gelişmesi için yeterli olabilmektedir. PZR ile hızlı ve doğru tanı konması tedaviye erken başlanması açısından önem taşımaktadır.

🔖

Cite This Article

DOĞAN, G., ŞAMLIOĞLU, P., BAYRAM, A. (2022). Evaluation of Clostridium difficile Toxin B results by polymerase chain reaction from stool specimens. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi, Cilt: 79 - Sayı: 2, 209–216. https://ajindex.com/articles/624890

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (7)

  1. Salman E, Levent B, Karahan ZC. Toksin pozitif C. difficile izolatlarının antimikrobiyal duyarlılıkları ve moleküler karakterizasyonu: Türkiye’den Hipervirülan Suşların Varlığı ile İlişkili İlk Bildirim. Mikrobiyol Bul 2017; 51(3): 236-46
  2. Jamal W, Pauline EM, Rotimi VO. Comparative performance of the GeneXpert C. difficile PCR assay and C. diff Quik Chek Complete kit assay for detection of C. difficile antigen and toxins in symptomatic community-onset infections. Int J Infect Dis 2014; 29: 244–8 3. Hammond GA, Johnson JL. The toxigenic element of C. difficile strain VPI 10463. Microb Pathog. 1995;19(4): 203-13
  3. Sambol SPMM, Merrigan D, Lyerly DN Gerding, Johnson S. Toxin gene analysis of a variant strain of C. difficile that causes human clinical disease. Infect. Immun 2000;68(10): 5480-7 5. Kostul H, Delialioğlu N, Horasan EŞ, Emekdaş G, Öztürk C, Kuyucu N.Hastanede yatan ishalli hastaların dışkı örneklerinde C. difficile toksin araştırılması ve risk faktörlerinin incelenmesi. Turk Hij Den Biyol Derg, 2015; 72(3): 183 - 90 6. Reller ME, Lema CA, Perl TM, Cai M, Ross TL, Speck KA, et al. Yield of stool culture with isolate toxin testing versus a two-step algorithm including stool toxin testing for detection of toxigenic C. difficile. J Clin Microbiol 2007; 45(11): 3601–5 7. Kılıç A. C. difficile Enfeksiyonu: Epidemiyoloji, Risk Faktörleri, Patogenez, Klinik Özellikler, Tanı ve Tedavi. Mikrobiyol Bul 2013; 47(3): 556-66
  4. Fawley WN, Parnell P, Verity P, Freeman J, Wilcox MH. Molecular epidemiology of endemic C. difficile infection and the significance of subtypes of the United Kingdom Epidemic Strain (PCR Ribotype 1). J Clin Microbiol 2005; 43(6): 2685–96 9. Johnson S. Recurrent C. difficile infection: a review of risk factors, treatments, and outcomes. J Infect 2009; 58(6): 403-10
  5. Deniz U, Ülger N, Aksu B, Karavuş M, Söyletir G. Marmara Üniversitesi Hastanesinde yatan ishalli hastalardan izole edilen C. difficile kökenlerinde toksin genlerinin araştırılması. Mikrobiyol Bul 2011; 45(1): 1-10
  6. Curry SR, Marsh JW, Muto CA, O’Leary MM, Pasculle AW, Harrison LH. tcdC genotypes associated with severe TcdC: truncation in an epidemic clone and other strains of C. difficile, J Clin Microbiol. 2007;45(1):215-21
  7. Kvach EJ, Ferguson D, Riska PF, Landry ML. Comparison of BD GenOhm C diff real-time PCR assay with two-step algorithm and a toxin A/B enzyme-linked immunosorbent assay for diagnosis of toxigenic C. difficile infection. J Clin Micro