Journals / Harran Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi / 2011 / Cilt: 15 - Sayı: 4

Determination of gen etic variation in the population of sclerotinia sclerotiorum in greenhouse grown lettuce by microsatellite markers

Örtüaltında yetiştirilen marulda sclerotınıa sclerotıorum populasyonunda genetik çeşitliliğin mikrosatelit markörler ile belirlenmesi

Pages
39–44
Publication Date
2022-10-17
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

A high level ofpolymorphism was found in lettuce populations originating from different locations but also withinpopulations from the same greenhouse.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Sclerotinia sclerotiorum is one of the most destructive pathogens of vegetable crops. inÇanakkale, lettuce is cultivated under greenhouses between November until end of March.Afterwards, lettuce is replaced with cucumber.
📊
Key Findings & Data:One of them ((TACA) 10) did not showpolymorphism among the isolates.
💡
Conclusion & Impact:A high level ofpolymorphism was found in lettuce populations originating from different locations but also withinpopulations from the same greenhouse.
🔬Design:Research Article
📍Scope:Comprehensive Sample
⚙️Variables:Domain Parameters

Abstract

Sclerotinia sclerotiorum is one of the most destructive pathogens of vegetable crops. inÇanakkale, lettuce is cultivated under greenhouses between November until end of March.Afterwards, lettuce is replaced with cucumber. Both are important hosts of the pathogen andinfected plants can be found throughout the year. Here, we tested if polymorphism exists in theis olates collected from the greenhouses. Eighteen isolates were employed in the research. Eightmicrosatellite primer sets were used for this purpose. One of them ((TACA) 10) did not showpolymorphism among the isolates. We found 2 alleles at (GT) 8, 3 alleles at (GA) 9, (TATG)9 , and(GT)10 loci. Five loci were observed at (CATA) 25 and (TTA) 9 alleles. The most obviouspolymorphism existed at (AGAT) 14(AAGC) 4 loci revealing 6 alleles. A high level ofpolymorphism was found in lettuce populations originating from different locations but also withinpopulations from the same greenhouse.

Özet

Sclerotinia sclerotiorum sebze yetiştiriciliğinde en yıkıcı patojenlerden biridir.Çanakkalede marul Kasımdan Mart ayına kadar örtü altında yetiştirilmekte, bu dönemlerdışındaki zamanlarda ise hıyar tarımı yapılmaktadır. Her iki bitki türü de hastalık etmenindenetkilenmekte ve yıl boyunca hastalık simptomlarını görmek mümkün olmaktadır. Bu çalışmanınamacı örtüaltında yetiştiriciliği yapılan marul seralarında, S. sclerotiorum un hastalıksimptomlarını gösteren bitkilerden etmeni izole etmek ve izolatlar arasında genetik çeşitliliği PCRyoluyla saptamaktır. Bu çalışmada 18 patojen izolatı, bu izolatlar arasında farklılığı saptamak içinise 8 mikrosatelit primeri kullanılmıştır. (TACA) 10 primeri kullanıldığında tüm izolatlardan aynıbüyüklükte PCR ürünü elde edilmiştir. (GT) 8 primeri kullanıldığında popülasyonda 2 farklıbüyüklükte, (GA)9 , (TATG) 9, ve (GT)10 locuslarında ise 3 farklı büyüklükte allel saptanmıştır.(CATA)25 ve (TTA)9 primerleri kullaınldığında 5er allel saptanırken, (AGAT) 14(AAGC) 4locusunda toplam 6 polimorfik banda rastlanmıştır. Marul populasyonunda yapılan bu çalışmada,izolatlar arasında yüksek oranda polimorfizm olduğu saptanmıştır.

🔖

Cite This Article

MERT, F. T. (2022). Determination of gen etic variation in the population of sclerotinia sclerotiorum in greenhouse grown lettuce by microsatellite markers. Harran Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, Cilt: 15 - Sayı: 4, 39–44. https://ajindex.com/articles/534517

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (5)

  1. Atallah ZK, Larget B, Johnson DA. (2004) High genetic diversity, phenotypic uniformity and evidence of outcrossing in Sclerotinia sclerotiorum in the Columbia basin of Washington State. Phytopathology 94:737 -742. Boland GC, Hall R. (1994) Index of plant hosts of Sclerotinia sclerotiorum. Can J Plant Pathol 2:93 – 108. Carpenter, M. A., Frampton, C. and Stewart, A. 1999. Genetic variation in New Zealand populations of the plant pathogen Sclerotinia sclerotiorum. N.Z. J. Crop Hortic. Sci. 27: 13 -21. Cubeta, M.A. Cody, B. R. Kohli Y. And L. M. Kohn. 1997. Clonality in Sclerotinia sclerotiorum on infected cabbage in Eastern North Carolina. Phtopathology. 87: 1000-1004.
  2. Glass, N. L. and Kuldau, G. A. 1992. Mating type and vegetative incompatibility in filamentous ascomycetes. Ann. Rev. Phytopathol. 30: 201 -224. Gaggiotti OE, Lange O, Rassmann K, Gliddon C. (1999) A comparison of two indirect methods for estimating average levels of gene flow using microsatellite data. Mol Ecol 8:1513 - 1520. Kohn LM, Carbone I, Anderson JB. (1990) Mycelial interactions in Sclerotinia sclerotiorum. Exp Mycol 14:255 -267. Kull, L. S. and Pedersen, W. L. 2004. Mycelial compatibility grouping and virulence of Sclerotinia sclerotiorum. Plant Dis. 88: 325 -332. Marciano, P., Dileena, P. and Magro, P. 1983. Oxalic acid, cell wall degrading enzymes and pH in pathogenesis and their significance in the virulence of two Sclerotinia sclerotiorum isolates on sunflower. Physiol. Plant Pathol. 22: 339-345.
  3. Malvarez, G., Carbone, I., Grunwald, N. J., Subbarao, K. V., Schafer, M. and Kohn, L. M. 2007. New populations of Sclerotinia sclerotiorum from lettuce in California and peas and lentils in Washington. Phytopathol. 97: 470-483.
  4. Mert-Türk, F., Ipek, M., Mermer, D., and Nicholson, P. (2007). Microsatellite and morphological markers reveal genetic variation within a population of Sclerotinia sclerotiorum from oilseed rape in the Çanakkale Province of Turkey. Journal of Phytopathology, 155, 182–187. Mert-Türk, F. ve D. Mermer, “Çanakkale Örtüaltı Marul Yetiştiriciliğinde Sclerotinia sclerotiorum ’un Yaygınlığının ve Miselyal Uyum Gruplarının Saptanması”. MKU Ziraat Fakültesi Dergisi, 9(1 -2), 1 -8, ( 2004).
  5. Onaran, A., Yanar, Y. 2007. Tokat ve Amasya Yöresinde Seralarda Hıyarlarda Görülen Beyaz Çürüklük Etmeni Sclerotinia sclerotiorum ’un Yaygınlığı ve Miselyal Uyumluluk Gruplarının Belirlenmesi Üzerine Araştırmalar. Türkiye II. Bitki Koruma Kongresi Bildirileri. s.283. Purdy LH. (1979) S