SavedAdd your journal

Journals / Experimed / 2011 / Cilt: 1 - Sayı: 2

Gen Anlatımı Analiz Yöntemlerine Genel Bakış

Evrim KOMURCU-BAYRAK
Nihan ERGİNEL-ÜNALTUNA
Journal
Experimed
Pages
28–35
Publication Date
2011-12-05
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

Sonuç olarak bu makalenin konusu, çıkartılmış hibridization kütüphanesi ve diğer gen ekspresyon analizi yöntemlerinin birbirleri ile karşılaştırmasıdır.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Çeşitli doku veya hücre serilerinde gözlenen biyolojik ve fizyopatolojik durumlar gen anlatımındaki kalitatif ve kantitatif farklılıklardan kaynaklanmaktadır.
📊
Key Findings & Data:Çıkartılmış hibridizasyon kütüphanesi yöntemi, araştırılan doku veya hücre hatlarında farklı olarak ifade edilen genlerin belirlenmesi ve izolasyonunda uygulanan güçlü yaklaşımlardan birisidir.
💡
Conclusion & Impact:Sonuç olarak bu makalenin konusu, çıkartılmış hibridization kütüphanesi ve diğer gen ekspresyon analizi yöntemlerinin birbirleri ile karşılaştırmasıdır.
🔬Design:Survey & Empirical Study
📍Scope:Comprehensive Sample
⚙️Variables:Domain Parameters

Özet

Çeşitli doku veya hücre serilerinde gözlenen biyolojik ve fizyopatolojik durumlar gen anlatımındaki kalitatif ve kantitatif farklılıklardan kaynaklanmaktadır. Karşılaştırmalı gen anlatım analizinde kullanılan çeşitli yaklaşımlar ve teknikler mevcuttur. Bu yöntemler dizileme temelli, PZR temelli, hibridizasyon temelli ve kombine yöntemler olarak sınıflandırılabilinir. Çıkartılmış hibridizasyon kütüphanesi yöntemi, araştırılan doku veya hücre hatlarında farklı olarak ifade edilen genlerin belirlenmesi ve izolasyonunda uygulanan güçlü yaklaşımlardan birisidir. Son dönemdeki teknolojik gelişmelere göre büyük ölçekli gen ifade analizleri ile çok sayıda genin biyolojik ve patolojik olaylardaki transkripsiyonel yanıtları hızlı olarak araştırılabilmektedir. Ancak, her tekniğin uygulamalarında çeşitli üstünlükler veya sınırlılıklar mevcuttur. Sonuç olarak bu makalenin konusu, çıkartılmış hibridization kütüphanesi ve diğer gen ekspresyon analizi yöntemlerinin birbirleri ile karşılaştırmasıdır.

🔖

Cite This Article

KOMURCU-BAYRAK, E., ERGİNEL-ÜNALTUNA, N. (2011). Gen Anlatımı Analiz Yöntemlerine Genel Bakış. Experimed, Cilt: 1 - Sayı: 2, 28–35. https://ajindex.com/articles/50934

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (9)

  1. Stanton LW. Methods to profile gene expression. Trends Cardiovascular Medicine 2001; 11: 49-54.
  2. Hess J, Laumen H, Wirth T. Application of differential cDNA screening techniques to the identification of unique gene expression in tumours and lymphocytes. Current Opinion in Immunology 1998; 10:125-130.
  3. Adams MD, Kelley JM, Gocayne JD, Dubnick M, Polymeropoulos MH, Xiao H, Merril CR, Wu A, Olde B, Moreno RF, ve ark. Complemantary DNA sequencing: expressed sequence tags and human genome project. Science 1991; 252: 1651-1656.
  4. Kodzius R, Matsumura Y, Kasukawa T, Shimokawa K, Fukuda S, Shiraki T, Nakamura M, Arakawa T, Sasaki D, Kawai J, Harbers M, Carninci P, Hayashizaki Y. Absolute expression values for mouse transcripts: re-annotation of the READ expression database by the use of CAGE and EST sequence tags. FEBS Letters 2004; 559, 22-6.
  5. Hill DP, Begley DA, Finger JH, Hayamizu TF, McCright U, Smith CM, Beal JS, Corbani LE, Blake JA, Eppig JT, Kadin JA, Richardson JE, Ringwald M. The mouse Gene Expression Database (GXD): updates and enhancements. Nucleic Acids Research 2004; 32, D568-71. Hwang DM, Dempsey AA, Lee C, Liew C. Identification of differentially expressed genes in cardiac hypertrophy by analysis of expressed sequence tags. Genomics 2000; 66,1-14.
  6. Tabibiazar R, Wagner RA, Liao A, Quertermous T. Transcriptional profiling of the heart reveals chamber-specific gene expression patterns. Circulation Resarch 2003; 93: 1193¬ 201. Velculescu VE, Zhang L, Vogelstein B, Kinzler KW. Serial analysis of gene expression. Science 1995; 270: 484¬ 487. Ye SQ, Lavoie T, Cusher D, Zhang LQ. Microarray, SAGE and their applications to cardivascular disease. Cell Research 2002; 12: 105-115.
  7. Reinartz J, Bruyns E, Lin JZ, Burcham T, Brenner S, Bowen B, Kramer M, Woychik R. Massively parallel signature sequencing (MPSS) as a tool for in-depth quantitative gene expression profiling in all organisms. Brief Funct Genomic Proteomic. 2002; 1: 95-104.
  8. Meyers BC, Tej SS, Vu TH, Haudenschild CD, Agrawal V, Edberg SB, Ghazal H, Decola S. The use of MPSS for whole-genome transcriptional analysis in Arabidopsis. Genome Res. 2004; 14:1641-53.
  9. Higuchi R, Fodder C, Dollinger G, Watson R. Kinetic PCR analysis: real-time monitoring of DNA amplification reactions. Biotechnology 1993; 11: 1026. Kubista M, Andrade JM, Bengtsson M, Forootan A, Jonâk J, Lind K, Sindelka R, Sjöback R, Sjögreen B, Strömbom L, Stâhlberg A, Zoric N. The real-time polymerase chain reaction. Molecular Aspects Medicine 2