AI Summary & Key Takeaways
AI InsightDespite the wrong positive and negative results arising from the reasons like inhibitors present in the environment, contaminant materials, mistakes arising from DNA isolation steps and being unable to standardize these methods, molecular methods are thought to maintain their importance.
📌 3 Key Takeaways
Abstract
OBJECTIVE: Meningitis is an infectious disease with high risk of complications that must be diagnosed and treated immediately. In most of the cases, meningitis treated empirically without knowing the etiology. This empirical choice of antimicrobial treatment is made according to the common pathogens present in that particular geographic region and antibiotic susceptibility of these pathogens and age of the patient. In this study, the aim was to determine bacterial and viral meningitis agents that might be present in the CSF of patients who are followed with early diagnosis of meningitis.METHODS: In our study, 100 CSF samples, which belongs to different patients, sent from multiple clinics with early diagnosis of meningitis were analyzed. Among the bacterial meningitis agents, the presence of Streptococcus pneumoniae, Neisseria meningitidis and Haemophilus influenzae were investigated by NHS Meningitis Real-TM Sacace, Italy and Speed-Oligo Bacterial Meningitis Test Vircell, Spain ; the presence of the HSV, as one of the agents of the aseptic meningitis, was investigated by HSV I/II Typing Real-TM Sacace, Italy and Attomol HSV 1 - 2 differentiation-DNA-LINA Vircell, Spain .RESULTS: With NHS Meningitis Real-TM method, 10 S. pneumonia, two N. meningitidis and one H. influenzae identified from CSF samples. By using the Speed-Oligo Bacterial Meningitis method, S. pneumoniae was identified in four of the samples and only in one sample N. meningitidis was identified. No H. influenzae was identified in any of the samples with this method. With HSV I/II Typing Real-TM, HSV positivity was identified in 5 of the CSF samples and 3 of them were identified as type 2 and other 2 were identified as type 1. With the use of Attomol HSV 1 - 2 method, HSV positivity was identified in 3 samples. All the HSVs determined with the use of this method were identified as type 1.CONCLUSION: For appropriate and adequate treatment of patients with meningitis, first of all the agent must be determined. With methods like PCR, it is possible to identify the agents early in the infection. Despite the wrong positive and negative results arising from the reasons like inhibitors present in the environment, contaminant materials, mistakes arising from DNA isolation steps and being unable to standardize these methods, molecular methods are thought to maintain their importance.
Özet
AMAÇ: Menenjit, tanısının hızla konarak erken tedavi yapılması gereken komplikasyonları yüksek bir enfeksiyon hastalığıdır. Menenjitlerin çoğunda etiyoloji bilinmeden ampirik tedaviye başlanması gerekmektedir. Bu ampirik antimikrobiyal tedavi seçimi, coğrafi bölgedeki yaygın olan patojenlere, hastanın yaşına ve o bölgedeki patojenlerin antibiyotik duyarlılıklarına göre yapılmaktadır. Çalışmada, menenjit ön tanısı ile takip edilen hastaların beyin omurilik sıvısı BOS örneklerinde moleküler testler kullanılarak bakteriyel ve viral etkenlerin belirlenmesi amaçlanmıştır. YÖNTEMLER: Çalışmamızda, menenjit ön tanısı ile çeşitli kliniklerden gönderilen farklı hastalara ait 100 BOS örneği incelenmiştir. Bakteriyel menenjit etkenlerinden Streptococcus pneumoniae, Neisseria meningitidis ve Haemophilus influenzae; NHS Meningitis Real-TM Sacace, Italy ve Speed-Oligo Bacterial Meningitis Test Vircell, Spain yöntemleri ile, aseptik menejit etkenlerinden HSV ise; HSV I/II Typing Real-TM Sacace, Italy ve Attomol HSV 1,2 differentiation-DNA-LINA Vircell, Spain yöntemleri ile araştırılmıştır. BULGULAR: NHS Meningitis Real-TM yöntemi ile BOS örneklerinde 10 S. pneumoniae, 2 N. meningitidis ve bir H. influenzae tespit edilmiştir. Speed-Oligo Bacterial Meningitis yöntemi kullanılarak; 4 örnekte S. pneumoniae ve 1 örnekte ise N. meningitidis saptanmıştır. Bu yöntem ile H. influenzae’ya rastlanmamıştır. HSV I/II Typing Real-TM ile 5 BOS örneğinde HSV pozitifliği belirlenmiştir. Tespit edilen HSV’ün 3’ü HSV tip 2 bulunmuş, 2’si ise HSV tip 1 olarak saptanmıştır. Attomol HSV 1-2 yöntemi kullanılarak da HSV pozitifliği 3 örnekte belirlenmiştir. Bu yöntem ile belirlenen tüm HSV’ler, HSV tip 1 olarak saptanmıştır. SONUÇ: Menenjit hastalarında uygun ve yeterli antimikrobiyal tedavi için öncelikle etkenin belirlenmesi gerekmektedir. PCR gibi moleküler yöntemlerle etkenlerin erken saptanması mümkün olmaktadır. Ortamda bulunan inhibitörler, kontaminant maddeler ve DNA izolasyonundan kaynaklanan hatalar ile yöntemin standardize olmaması gibi nedenlerden kaynaklanan yanlış pozitif ve yanlış negatif sonuçlara rağmen moleküler yöntemlerin önemini koruduğu düşünülmektedir.