Journals / Tekirdağ Ziraat Fakültesi Dergisi / 2018 / Cilt: 15 - Sayı: 3

Determination of Appropriate Method(s) to Detect Watermelon Seedling Blight And Fruit Blotch Disease Agent Acidovorax citrulli in Cucurbit Seeds

Kabakgil Tohumlarında Karpuz Bakteriyel Fide Yanıklığı ve Meyve Lekesi Hastalığı Etmeni Acidovorax citrulli’nin Varlığının Belirlenmesinde Kullanılabilecek Uygun Yöntem(ler)in Saptanması

Pages
36–43
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

This study recommended that this BIO-PCR is safe, reliable and fast for detection Ac from cucurbit seeds without any seedling growth.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Watermelon seedling blight and fruit blotch caused by Acidovorax citrulli (Ac) is a seed-borne bacterial disease.
📊
Key Findings & Data:Cucurbit seeds were homogenised using a blender and left in orbital shaker for 24 h in a nutrient broth.
💡
Conclusion & Impact:This study recommended that this BIO-PCR is safe, reliable and fast for detection Ac from cucurbit seeds without any seedling growth.
🔬Design:Research Article
📍Scope:Comprehensive Sample
⚙️Variables:Domain Parameters

Abstract

Watermelon seedling blight and fruit blotch caused by Acidovorax citrulli (Ac) is a seed-borne bacterial disease. The bacterium survives in/on seeds for years. The aim of this study was to determine the most favourable, reliable and fast method for detection Ac from cucurbit seeds. Cucurbit seeds were homogenised using a blender and left in orbital shaker for 24 h in a nutrient broth. The methods seedling grow out, pathogen isolation from seed washing water dilutions onto semi selective media P-278 and mEBB and general medium King B, DAS-ELISA and BIO-PCR were used for detection. Water-soaked lesions observed on cotyledons. Since DAS-ELISA and PCR tests with seed dilutions onto King B has failed to detect Ac from seed lots, Ac specific PCR with dilutions from semi selective media has successfully detect the pathogen. As a result of this study, four (one cucumber, one melon and two watermelon seed lots) out of twenty two tested cucurbit seeds were contaminated with Ac. This study recommended that this BIO-PCR is safe, reliable and fast for detection Ac from cucurbit seeds without any seedling growth.

Özet

Karpuz bakteriyel fide yanıklığı ve meyve lekesi hastalığı etmeni Acidovorax citrulli (Ac) tohumla taşınan bir bakteriyeletmendir. Bakteri tohum kabuğunda ve embriyosunda uzun yıllar yaşamını sürdürür. Bu çalışma, tohum kökenlihastalık etmeni Ac’nin tohumda varlığının belirlenmesinde kullanılabilecek en uygun, hızlı ve güvenilir yöntem(ler)inbelirlenmesi amacıyla yapılmıştır. Bu amaçla kabakgil tohumları parçalayıcıda parçalanarak homojenize edilmiş, dahasonra sıvı besi yerinde 24 saat orbital çalkalayıcı içinde çalkalanmıştır. Tohumda etmenin aranmasında fidede belirtiizleme, tohum çalkalama suyundan genel bir besi yeri olan King B, yarı seçici besi yerleri P-278 ve mEBB’ye ekim ilebakteri izolasyonu yapılmış, tanılama çalışmalarında türe spesifik ELISA ve türe spesifik BIO-PCR yöntemlerikullanılmıştır. Çalışma sonucunda, tohumdan gelişen fidede kotiledon yapraklarda su emmiş alanlar olduğugözlenmiştir. Ancak tohum çalkalama suyunun genel besi yerine ekimi ile yapılan DAS-ELISA ve PCR testi sonuçvermemiştir. Yarı seçici besi yerlerine ekim ve gelişen bakterilerin toplanarak etmene spesifik PCR testleriyle patojeninvarlığı başarılı bir şekilde belirlenmiştir. Geliştirilen bu yöntemle karpuz, karpuz anacı, kavun ve hıyar tohumlarınıiçeren 22 farklı kabakgil tohum örneği Ac varlığı yönünden incelenmiş ve dört örneğinin (bir hıyar, bir kavun ve ikikarpuz) patojenle bulaşık olduğu saptanmıştır. Çalışma sonucunda belirlenen bu BIO-PCR yöntemine göre, kabakgiltohumları fide haline getirilmeden uygun ve hızlı bir şekilde bu patojenin varlığı yönünden incelenebilir.

🔖

Cite This Article

HORUZ, S., AYSAN, Y. (2018). Determination of Appropriate Method(s) to Detect Watermelon Seedling Blight And Fruit Blotch Disease Agent Acidovorax citrulli in Cucurbit Seeds. Tekirdağ Ziraat Fakültesi Dergisi, Cilt: 15 - Sayı: 3, 36–43. https://ajindex.com/articles/366423

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (8)

  1. Aysan, Y., S. Horuz, R. Cetinkaya Yildiz, M. Mirik ve H. Saygili, 2011. Karpuz üretim alanlarında Acidovorax avenae subsp. citrulli’nin yayılmasında tohum kökenli bulaşmaların önemi. Türkiye IV. Tohumculuk Kongresi, 14-17 Haziran 2011, Samsun, 292-293 s. Bahar, O., M. Efrat, E. Hadar, B. Dutta, R.R. Walcott, and S. Burdman, 2008. New subspecies-specific polymerase chain reactionbased assay for the detection of Acidovorax avenae subsp. citrulli. Plant Pathology, 57 (4):754-763.
  2. Block, C.C. and L.M. Shepherd, 2008. Long-term survival and seed transmission of Acidovorax avenae subsp. citrulli in melon and watermelon seed. Plant Health Progress, DOI:10.1094/PHP-2008-1219-01-BR. Demir, G. 1996. A new bacterial disease of watermelon in Turkiye: Bacterial fruit blotch of watermelon (Acidovorax avenae subsp. citrulli (Schaad et. al.) Williams et al.). Journal of Turkish Phytopathology, 25(2):43-49.
  3. Dutta, B. M.A.C. Vernaiz, A.C. Castro-Sparks, H. Scherm, and R.R. Walcott, 2012. Location of Acidovorax citrulli in watermelon seeds affects efficiency of pathogen detection by seed health testing. Seed Science and Technology, 40 (3):309-319.
  4. Feng, J.J. J.O. Li, R.R. Walcott, G.M. Zhang, L.X. Luo, L. Kang, Y. Zheng, and N.W. Schaad, 2013. Advances in detection of Acidovorax citrulli, the causal agent of bacterial fruit blotch of cucurbits. Seed Science and Technology, 41 (1):1-15.
  5. Horuz, S. 2014. Karpuzda bakteriyel meyve lekesi hastalığı etmeni Acidovorax citrulli’nin tanısı, moleküler karakterizasyonu ve bakteriyel antagonistlerle biyolojik mücadelesi. Ç.Ü, Fen Bilimleri Enstitüsü, Bitki Koruma Anabilim Dalı Doktora tezi, 203 s. Horuz, S. and Y. Aysan 2018. Biological control of watermelon seedling blight caused by Acidovorax citrulli using antagonistic bacteria from the genera Curtobacterium, Microbacterium and Pseudomonas. Plant Protection Science (basımda). Jarret, R.L. and M. Newman, 2000. Phylogenetic relationships among species of Citrullus and the placement of C. rehmii De Winter as determined by Internal Transcribed Spacer (ITS) Sequence heterogeneity. Genetic Resources and Crop Evolution, 47(2):215-222.
  6. Johnson, K.L. and R.R. Walcott, 2013. Quorum sensing contributes to seed-to seedling transmission of Acidovorax citrulli on watermelon. Journal of Phytopathology, 161 (7):562-573.
  7. King, E.O. M.K. Ward, and D.E. Raney, 1954. Two simple media for the demonstration of pyocianin and floresin. J.Lab. Clin. Med. 44:301-307.
  8. Mengulluoglu, M. and S. Soylu 2012. Antiba