Journals / Şişli Etfal Hastanesi Tıp Bülteni / 2015 / Cilt: 49 - Sayı: 4

Determination of candida species and their antifungal susceptibilities isolated from inpatients

Yatan Hastalardan İzole Edilen Candida Türlerinin ve Antifungal Duyarlılıklarının Belirlenmesi

Pages
266–273
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

It would be appropriate to confirm intermediate and resistant results using reference methods.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Objective: Fungi have emerged as major causes of human disease recently, especially among the immuno- compromised patients and those hospitalized with serious underlying diseases.
📊
Key Findings & Data:Material and Method: Test results of yeasts that were isolated from 45 blood, 10 urine, three bronchoalveo- lar lavage and one catheter samples of the patients during the period January 2011-December 2013 in our laboratory were evaluated.The yeasts were identifed by germ tube test, CHROMagar Candida (CHROMagar, Paris, France) and AuxaColor (Bio-Rad SDP, Paris, France) commercial identifcation system.
💡
Conclusion & Impact:It would be appropriate to confirm intermediate and resistant results using reference methods.
🔬Design:Research Article
📍Scope:2011 Verileri
⚙️Variables:Domain Parameters

Abstract

Objective: Fungi have emerged as major causes of human disease recently, especially among the immuno- compromised patients and those hospitalized with serious underlying diseases. The aim of this study was to identify Candida species isolated from different cultures and determine their antifungal susceptibilities retrospectively and define of value of using commercial system. Material and Method: Test results of yeasts that were isolated from 45 blood, 10 urine, three bronchoalveo- lar lavage and one catheter samples of the patients during the period January 2011-December 2013 in our laboratory were evaluated.The yeasts were identifed by germ tube test, CHROMagar Candida (CHROMagar, Paris, France) and AuxaColor (Bio-Rad SDP, Paris, France) commercial identifcation system. The antifungal susceptibility tests were performed using Fungitest (Bio-Rad SDP, Paris, France) commercial system. Results: The distribution of 71 candida species was as follows: 28 Candida albicans (39%), 13 Candida parap- silosis (18.3%), 11 Candida glabrata (15.5%), 10 Candida tropicalis (14.1%), four Candida krusei (5.6%), three Candida lusitaniae (4.2%), one Candida kefyr (1.4%) and one Candida dubliniensis (1.4%). A intermediate C.parapsilosis strain to Amfoterisin B and a resistant C.tropicalis strain to Amfoterisin are evaluated using E-test and found resistant with a minimum inhibitor concentration (MIC) value of 1.5 µg/ml for both of them. The MIC rates of two out of three fluconazole (FLU) intermediate and one resistant C.albicans strains were evaluated using E-test and all three strains were found resistant with a MIC value of 256 µg/ml. The MIC of a FLU intermediate C.albicans strain to FLU was 32 µg/ml. The MIC of a C.tropicalis strain that was FLU resistant with Fungitest was 0,38 µg/ml and was evaluated as susceptible. Conclusion: In our study, it is important knowledge of species and antifungal susceptibility test results for control of fungal infections and plan of treatment. We used Auxacolor and Fungitest in our study. And this tests were easy to use and to evaluate. It should be carefully evaluated of the Fungitest results which don’t accord with the actual guidelines. It would be appropriate to confirm intermediate and resistant results using reference methods.

Özet

Amaç: Son yıllarda mantar infeksiyonları, özellikle immünsüpresif tedavi alan ya da altta yatan bir risk faktörü nedeniyle hastanede yatan hastalarda başlıca infeksiyon etkeni olarak ortaya çıkmıştır. Bu çalışmada farklı klinik örneklerden izole edilen Candida türlerinin dağılımının ve duyarlılıklarının retrospektif olarak incelenmesi ve kullanılmış olan ticari kitlerin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Ocak 2011-Aralık 2013 tarihleri arasında laboratuvarımıza gelen hasta örneklerinden, maya mantarı soyutlanan 45i kan, 12si steril vücut sıvısı, 10u idrar, üçü bronkoalveolar lavaj, biri kateter olmak üzere toplam 71 klinik örnek incelemeye alınmıştır. Çalışmaya alınan örneklerden soyutlanan maya mantarları; germ tüp yöntemi, CHROMagar Candida (CHROMagar, Paris, France) ve AuxaColor (Bio-Rad SDP, Paris, France) ticari kitiyle tiplendirilmiştir. Maya mantarlarının antifungal duyarlılıkları Fungitest (Bio-Rad SDP, Paris, France) ticari kiti ile belirlenmiştir. Bulgular: AuxaColor ile değerlendirilen toplam 71 Candida suşunun 28i (%39) Candida albicans, 13ü (%18.3) C. parapsilosis, 11i (%15.5) C. glabrata, 10u (%14.1) C. tropicalis, dördü (%5.6) C. krusei, üçü (%4.2) C. lusitaniae, birer tane ise (%1.4) C. kefyr ve C. dubliniensis olarak tanımlanmıştır. Fungitest ile değerlendirilen 47 suştan Amfoterisin Bye orta duyarlı olan bir C. parapsilosis suşu ve dirençli olan bir C. tropicalis Etest metodu ile incelenmiş, minimum inhibitör konsantrasyon (MİK) 1.5 µg/ml bulunmuştur. Flukonazole (FLU) orta duyarlı üç C. albicans suşu Etest metodu ile değerlendirilmiş ikisinin MİK değeri 256 µg/ml olarak, biri 32 µg/ml olarak bulunmuştur. FLUya dirençli olan bir adet C.albicans suşu MİK değeri Etest metodu ile 256 µg/ml olarak bulunmuştur. Dirençli olan C. tropicalis suşunun MİK değer ise 0,38 µg/ml olarak bulunmuştur. Sonuç: Çalışmamızda fungal infeksiyonların kontrolü için tür tayini ve antifungal duyarlılık test sonuçlarının bilinmesi önemli olduğu ve antifungal ajanlara karşı gittikçe artan direnç oranları nedeniyle tedavi planlamasında duyarlılık testlerinin giderek daha önem kazandığı sonucuna varılmıştır. Kullandığımız Auxacolor ve Fungitestin uygulanmasının ve değerlendirilmesinın kolay ve pratik bir test olduğu görülmüştür. Fungitest duyarlılık sonuçları mevcut guidelinelarda ki antifungal dilüsyonlar ile uyumluluk göstermediğinden dikkatle değerlendirilmelidir. Ayrıca orta duyarlı ve dirençli sonuçların referans yöntemlerle teyit edilmesi uygun olacaktır.

🔖

Cite This Article

TOGAY, A., BAYRAKTAR, B., YILDIZ, D. S., BULUT, E. (2015). Determination of candida species and their antifungal susceptibilities isolated from inpatients. Şişli Etfal Hastanesi Tıp Bülteni, Cilt: 49 - Sayı: 4, 266–273. https://ajindex.com/articles/363841

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (13)

  1. Pfaller MA, Diekema DJ. Epidemiology of invasive candidiasis: a persistent public health problem. Clin Microbiol Rev 2007; 20: 133-63
  2. Beck-Sagué CM, Jarvis WR. Secular trends in the epidemiology of nosocomial fungal infections in the United States, 1980-1990. The Journal of Infectious Diseases 1993: 1247-51
  3. Valente P, Ramos J, Leoncini O. Sequencing as a tool in yeast molecular taxonomy. Can J Microbiol 1999; 45: 949-58
  4. Özyavuz-Alp ŞUÖ. Nozokomiyal Fungal Enfeksiyonlar. Doğanay MÜS, Şardan Y (editor). Hastane İnfeksiyonları. Ankara: Bilimsel Tıp Yayınevi; 2013. p. 459-86
  5. Şahin E, Ersöz G, Otağ F, Kandemir Ö, Tiftik N, Kaya A ve ark. Hematolojik maligniteli nötropenik ateşli hastalardan izole edilen Candida türlerinin değerlendirilmesi. İnfeksiyon Dergisi 2006; 20: 121-4
  6. Mokaddas EM, Al-Sweih NA, Khan ZU. Species distribution and antifungal susceptibility of Candida bloodstream isolates in Kuwait: a 10-year study. Journal of Medical Microbiology 2007; 56: 255-9
  7. Takakura S, Fujihara N, Saito T, Kudo T, Iinuma Y, Ichiyama S, et al. National surveillance of species distribution in blood isolates of Candida species in Japan and their susceptibility to six antifungal agents including voriconazole and micafungin. J Antimicrob Chemother 2004; 53: 283-9
  8. Pfaller M, Diekema D, Gibbs D, Newell V, Meis J, Gould I, et al. Results from the ARTEMIS DISK Global Antifungal Surveillance Study, 1997-2005: An 8.5-year analysis of susceptibilities of Candida and other yeast species to fluconazole and voriconazole by CLSI standardized disk diffusion testing. J Clin Microbiol 2007; 45: 1735-45
  9. Özbek E, Tekay F, Pirinççioğlu HÇ. Yoğun bakım hastalarına ait çeşitli örneklerden izole edilen Candida izolatlarında antifungal direnç. Dicle Tıp Dergisi 2012; 39:207-12
  10. Comert F, Kulah C, Aktas E, Eroglu O, Ozlu N. Identification of Candida species isolated from patients in intensive care unit and in vitro susceptibility to fluconazole for a 3-year period. Mycoses 2007; 50: 52-7
  11. Zer Y, Balci I, Meric G. Identification and antifungal susceptibility of Candida isolated from intensive care unit patients. New Microbiol 2002; 25: 489-94
  12. Celebi S, Hacimustafaoglu M, Ozdemir O, Ozkaya G. Nosocomial candidaemia in children: results of a 9-year study. Mycoses 2008; 51: 248-57
  13. Aslan FOG, Şen S, Özturhan H, Emekdaş G. 2003-2005 süresinde klinik örneklerden izole edilen maya türlerinin değerlendirilmesi. İnfeksiyon Dergisi 2005; 19: 435-43