Journals / Uluslararası Hematoloji-Onkoloji Dergisi / 2017 / Cilt: 27 - Sayı: 1

Akut Lösemi Hastalarında APC Tümör Baskılayıcı Geninin Artmış Hipermetilasyonu

Aberrant Hypermethylation of APC Tumor Supressor Gene in Acute Leukemia Patients

Pages
1–7
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

APC anlatımı ile klinik parametreler arasında bir korelasyon gözlememekle birlikte, APC promotör metilasyonunun farklı ALL fenotipleri arasında farklı gen anlatım düzeylerine neden olduğu gözlenmiştir.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:WNT sinyal ileti yolağı evrimsel olarak korunmuş, lenfosit progenitor hücrelerin büyümesi ve farklılaşmasında görevli önemli bir yolaktır.
📊
Key Findings & Data:Bu çalışmada APC geni ekspresyonu ve metilasyonu çocukluk çağı akut lenfoblastik ve myeloblas-tik lösemi hastalarında (n= 118) metilasyon spesifik PZR ve eş zamanlı kantitatif PZR ile incelenmiştir.
💡
Conclusion & Impact:APC anlatımı ile klinik parametreler arasında bir korelasyon gözlememekle birlikte, APC promotör metilasyonunun farklı ALL fenotipleri arasında farklı gen anlatım düzeylerine neden olduğu gözlenmiştir.
🔬Design:Research Article
📍Scope:Comprehensive Sample
⚙️Variables:Domain Parameters

Abstract

WNT sinyal ileti yolağı evrimsel olarak korunmuş, lenfosit progenitor hücrelerin büyümesi ve farklılaşmasında görevli önemli bir yolaktır. Son yıllarda yapılan çalışmalar WNT sinyal ileti yolağının hematopoetik malignansilerde de önemli bir yeri olduğuna işaret etmektedir. WNT sinyal ileti yolağında görev alan APC geni, B-katenini degrede eden degredasyon kompleksi elemanlarından birisi olması ned-eniyle yolağın negatif regülasyonunda anahtar role sahiptir. Gende meydana gelen inaktive edici mutasyonlar veya metillenme, WNT aktivasyonuna sebep olmaktadır. Bu çalışmada APC geni ekspresyonu ve metilasyonu çocukluk çağı akut lenfoblastik ve myeloblas-tik lösemi hastalarında (n= 118) metilasyon spesifik PZR ve eş zamanlı kantitatif PZR ile incelenmiştir. APC geni promotör bölgesi hastaların %56’sında (%49.2 B-ALL, %62.5 T-ALL %64.1 AML hastalarında) hipermetile olarak tespit edilmiştir. Metilasyonun, gen ek spresyonuna olan etkisini değerlendirmek için APC mRNA seviyeleri incelendiğinde tüm akut lenfoblastik lösemi hastalarında anlatımın kontrollere göre istatistiksel olarak azaldığı görülmüştür. APC anlatımı ile klinik parametreler arasında bir korelasyon gözlememekle birlikte, APC promotör metilasyonunun farklı ALL fenotipleri arasında farklı gen anlatım düzeylerine neden olduğu gözlenmiştir.

Özet

Wingless Type (WNT) signaling pathway is an evolutionarily conserved pathway that is crucial for the cell fate determination, survival and expansion of lymphocyte progenitors. It has been demonstrated that deregulated WNT signaling is one of the participating mechanism underlying lymphoid leukemogenesis. Inactivating mutations and methylation in Adenomatous Polyposis Coli (APC) gene, a negative regulator of WNT pathway, can cause ligand independent WNT pathway simulation. In this study, promoter methylation and expression of the APC gene is evaluated in childhood lymphoid and myeloid acute leukemia patients (n= 118) and representa-tive cell lines by using methylation specific PCR (MS-PCR) and real time quantitative PCR (QRT-PCR). APC gene promoter found hypermethylated in the 56% of childhood acute leukemia patients [49.2% of B-cell acute lymphoblastic leukemia (B-ALL), 62.5% of T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) and 64.1% of Acute myeloid leukemia (AML)]. To evaluate the reflection of promoter methylation, APC mRNA levels were examined and found that all acute lymphoblastic leukemia subgroups have statistically lower APC expression levels compared to controls. Although there was no association with clinical parameters, promoter hypermethylation of APC gene seems to be a common epigenetic event in acute leukemia and leading to differential expression levels among different acute leukemia phenotypes.

🔖

Cite This Article

NG, Ö. H., FIRTINA, S., ERBİLGİN, Y., ÖZBEK, U., SAYİTOĞLU, M. (2017). Akut Lösemi Hastalarında APC Tümör Baskılayıcı Geninin Artmış Hipermetilasyonu. Uluslararası Hematoloji-Onkoloji Dergisi, Cilt: 27 - Sayı: 1, 1–7. https://ajindex.com/articles/322795

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (15)

  1. Griffiths EA, Gore SD, Hooker C, et al. Acute myeloid leukemia is characterized by Wnt pathway inhibitor promoter hyper-methylation. Leuk Lymphoma 51: 1711-1719, 2010.
  2. Tsuchiya T, Tamura G, Sato K, et al. Distinct methylation pat-terns of two APC gene promoters in normal and cancerous gastric epithelia. Oncogene 19: 3642-3646, 2000.
  3. Hatirnaz Ng Ö, Firtina S, Can I, et al. A possible role for WNT5A hypermethylation in Pediatric Acute Lymphoblastic Leukemia. Turkish Journal of Hematology 32: 127-135, 2015.
  4. Yang Y, Takeuchi S, Tsukasaki K, et al. Methylation analysis of the adenomatous polyposis coli (APC) gene in adult T-cell leukemia/lymphoma. Leuk Res 29: 47-51, 2005.
  5. Kawakami K, Brabender J, Lord RV, et al. Hypermethylated APC DNA in plasma and prognosis of patients with esophage-al adenocarcinoma. J Natl Cancer Inst 92: 1805-1811, 2000.
  6. Esteller M, Corn PG, Baylin SB, Herman JG. A gene hyper-methylation profile of human cancer. Cancer Res 61: 3225- 3229, 2001.
  7. Dong SM, Kim HS, Rha SH, Sidransky D. Promoter hyper-methylation of multiple genes in carcinoma of the uterine cer-vix. Clin Cancer Res 7: 1982-1986, 2001.
  8. Grote HJ, Schmiemann V, Kiel S, et al. Aberrant methylation of the adenomatous polyposis coli promoter 1A in bronchial as-pirates from patients with suspected lung cancer. Int J Cancer 110: 751-755, 2004.
  9. Sasikumar R, Rejitha JR, Binumon PK, Manoj M. Role of het-erozygous APC mutation in niche succession and initiation of colorectal cancer--a computational study. PLoS One 6: e22720, 2011.
  10. Miyaki M, Iijima T, Kimura J, et al. Frequent mutation of beta-catenin and APC genes in primary colorectal tumors from pa-tients with hereditary nonpolyposis colorectal cancer. Cancer Res 59: 4506-4509, 1999.
  11. Livak KJ, Schmittgen TD. Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2(-Delta Delta C(T)) Method. Methods 25: 402-408, 2001
  12. Vandesompele J, De Preter K, Pattyn F, et al. Accurate nor-malization of real-time quantitative RT-PCR data by geometric averaging of multiple internal control genes. Genome Biol 7: RESEARCH0034, 2002.
  13. Frommer M, McDonald LE, Millar DS, et al. A genomic se-quencing protocol that yields a positive display of 5-methylcy-tosine residues in individual DNA strands. Proc Natl Acad Sci U S A 89: 1827-1831, 1992.
  14. Erbilgin Y, Ng OH, Mavi N, et al. Genetic alterations in mem-bers of the Wnt pathway in acute leukemia. Leuk Lymphoma 53: 508-510, 2012.
  15. Esteller M, Herman JG. Cancer as an epigenetic disease: D