Journals / Mikrobiyoloji Bülteni / 2011 / Cilt: 45 - Sayı: 2

Investigation of antifungal susceptibilities and some virulence factors of Candida strains isolated from blood cultures and genotyping by RAPD-PCR

Kan kültürlerinden izole edilen Candida suşlarında antifungal duyarlılığın ve bazı virülans faktörlerinin araştırılması ve RAPD-PCR ile genotiplendirilmesi

Pages
306–317
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

In conclusion, the Candida spp. isolated from blood samples were highly susceptible to the tested antifungals, and C.albicans strains had high phospholipase and esterase activity, while C.parapsilosis strains had high rate of positivity for biofilm formation.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Candidemia is a serious clinical picture with a rather high mortality.
📊
Key Findings & Data:A total of 46 Candida spp. strains isolated from blood cultures of patients of whom eight were newborn and 38 were adults, between the period of February 2005 to July 2010, were included in the study.
💡
Conclusion & Impact:In conclusion, the Candida spp. isolated from blood samples were highly susceptible to the tested antifungals, and C.albicans strains had high phospholipase and esterase activity, while C.parapsilosis strains had high rate of positivity for biofilm formation.
🔬Design:Research Article
📍Scope:2005 Verileri
⚙️Variables:Domain Parameters

Abstract

Candidemia is a serious clinical picture with a rather high mortality. Early diagnosis and appropriate treatment is crucial in this picture especially in immunocompromised cases. The aims of this retrospective study were to investigate the antifungal susceptibility patterns and to detect the presence of phospholipase, esterase and biofilm production which are excepted as virulence factors of Candida spp. strains and to evaluate the clonal relationships between isolates. A total of 46 Candida spp. strains isolated from blood cultures of patients of whom eight were newborn and 38 were adults, between the period of February 2005 to July 2010, were included in the study. Of the isolates 17 were identified as C.albicans, 18 were C.parapsilosis, five were C.glabrata, four were C.tropicalis, one was C.guilliermondii and one was C.krusei. Antifungal susceptibility tests were performed by using “Sensititre Yeast One (Trek Diagnostic Systems, USA)” commercial kit. Esterase activity was detected in Tween-80 medium; phospholipase activity in yolk egg agar and biofilm formation was investigated by microplate assay. Strain genotyping was performed by RAPD-PCR (random amplified polymorphic DNA-polymerase chain reaction) by using OPE-03, OPE-18, AP50-1, Cnd-3 and Cnd-4 primers. All strains were found to be susceptible to amphotericin B, voriconazole, posaconazole, and caspofungin. C.krusei strain was defined as resistant (intrinsically) to fluconazole. All strains of C.albicans, C.parapsilosis, C.glabrata, and C.tropicalis were found to be susceptible to fluconazole. Three of five C.glabrata strains were resistant to itraconazole, while the other strains were found to be susceptible. All of the C.albicans strains had phospholipase and esterase activity, however none were biofilm-producing isolates. In contrast all of the C.parapsilosis strains were negative for phospholipase and esterase activity, however all were positive for biofilm formation. Phospholipase activity has not been detected in non-albicans strains; esterase activity were found positive in all of the C.tropicalis strains, while biofilm formation was detected in three C.tropicalis, one C.glabrata and one C.krusei isolates. The results of genotyping demonstrated that C.albicans strains displayed 5-8 different patterns and C. parapsilosis strains 2-3 patterns with the use of five primers. Among C.parapsilosis strains, 14 were found identical (with the use of all the primers forming a single pattern (pattern A). In conclusion, the Candida spp. isolated from blood samples were highly susceptible to the tested antifungals, and C.albicans strains had high phospholipase and esterase activity, while C.parapsilosis strains had high rate of positivity for biofilm formation. The predominant pattern amongst C.parapsilosis strains was thought to be related to exogenous dissemination.

Özet

Kandidemi yüksek mortalite ile seyreden ciddi bir klinik tablodur. Özellikle immünyetmezlikli olgularda sık görülen bu tabloda erken tanı ve uygun tedavi önem taşır. Bu retrospektif çalışmada, kan kültürlerinden izole edilmiş olan Candida suşlarının antifungal duyarlılık paternlerinin belirlenmesi; virülans faktörü olarak kabul edilen fosfolipaz, esteraz ve biyofilm oluşturma özelliklerinin araştırılması ve izolatlar arasındaki klonal ilişkinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Çalışmaya, laboratuvarımızda Şubat 2005-Temmuz 2010 tarihleri arasında, sekizi yenidoğan, 38’i ise erişkin hastaların kan kültürlerinden izole edilen 46 Candida spp. suşu alınmıştır. Suşların 17’si C.albicans, 18’i C.parapsilosis, beşi C.glabrata, dördü C.tropicalis, biri C.guilliermondii ve biri C.krusei olarak tanımlanan izolatlardır. Antifungal duyarlılık testleri “Sensititre Yeast One (Trek Diagnostic Systems, ABD)” ticari kiti ile yapılmış; esteraz aktivitesi Tween-80’li besiyerinde, fosfolipaz aktivitesi yumurta sarılı agarda araştırılmış ve biyofilm oluşturma özelliğinin belirlenmesinde mikroplak yöntemi kullanılmıştır. Suşların genotiplendirilmesi; OPE- 03, OPE-18, AP50-1, Cnd-3 ve Cnd-4 primerleri kullanılarak “Random Amplified Polymorphic DNAPolymerase Chain Reaction (RAPD-PCR)” yöntemiyle yapılmıştır. Çalışmamızda, tüm suşların amfoterisin B, vorikonazol, posakonazol ve kaspofungine duyarlı olduğu saptanmıştır. C.albicans, C.parapsilosis, C.glabrata ve C.tropicalis suşları flukonazole duyarlı bulunurken, C.krusei suşu flukonazole doğal dirençli kabul edilmiştir. Beş C.glabrata izolatının üçünde itrakonazol direnci belirlenmiş, diğer tüm suşların itrakonazole duyarlı olduğu görülmüştür. C.albicans suşlarının tümünde fosfolipaz ve esteraz aktivitesi pozitif, biyofilm oluşumu negatif iken, tüm C.parapsilosis suşlarının fosfolipaz ve esteraz aktivitesi negatif, biyofilm oluşumu pozitif bulunmuştur. Fosfolipaz aktivitesine hiçbir albicans-dışı türde rastlanmamış; C.tropicalis suşlarının hepsinde esteraz pozitifliği saptanırken, üç C.tropicalis, bir C.glabrata ve bir C.krusei izolatının biyofilm oluşturma özelliğine sahip olduğu izlenmiştir. Genotiplendirme sonucunda; beş farklı primer ile C.albicans suşları 5-8 patern, C.parapsilosis suşları ise 2-3 patern oluşturmuş, C.parapsilosis izolatlarından 14’ü primerlerin hepsi ile aynı bulunarak tek bir paternde (patern A) toplanmıştır. Sonuç olarak çalışmamızda, kandan izole edilen Candida spp. izolatlarının test edilen antifungal ajanlara karşı duyarlılıklarının oldukça yüksek olduğu görülmüş; C.albicans suşlarında yüksek oranda fosfolipaz ve esteraz, C.parapsilosis suşlarında yüksek oranda biyofilm pozitifliği saptanmıştır. C.parapsilosis izolatları arasında bulunan baskın paternin ise ekzojen yayılımla ilişkili olabileceği düşünülmüştür.

🔖

Cite This Article

GÜLTEKİN, B., EYİGÖR, M., TİRYAKİ, Y., KIRDAR, S., AYDIN, N. (2011). Investigation of antifungal susceptibilities and some virulence factors of Candida strains isolated from blood cultures and genotyping by RAPD-PCR. Mikrobiyoloji Bülteni, Cilt: 45 - Sayı: 2, 306–317. https://ajindex.com/articles/299323

References (13)

  1. Pfaller MA, Diekema DJ. Epidemiology of invasive candidiasis: a persistent public health problem. Clin Microbiol Rev 2007; 20(1): 133-63
  2. Diekema DJ, Messer SA, Boyken LB, et al. In vitro activity of seven systemically active antifungal agents against a large global collection of rare Candida species as determined by CLSI broth microdilution methods. J Clin Microbiol 2009; 47(10): 3170-7
  3. Tan TY, Tan AL, Tee NW, Ng LS. A retrospective analysis of antifungal susceptibilities of Candida bloodstream isolates from Singapore hospitals. Ann Acad Med Singapore 2008; 37(10): 835-40
  4. Altuncu E, Bilgen H, Cerikçioğlu N ve ark. Neonatal Candida enfeksiyonları ve etkenlerinin antifungal duyarlılıkları. Mikrobiyol Bul 2010; 44(4): 593-603
  5. Gil-Lamaignere C, Roilides E, Hacker J, Muller FM. Molecular typing for fungi-a critical review of the possibilities and limitations of currently and future methods. Clin Microbiol Infect 2003; 9(3): 172-85
  6. Akyol V, Çerikçioğlu N. Candida parapsilosis klinik izolatlarının morfotiplendirilmesi, genotiplendirilmesi ve farklı morfotiplerde bazı virülans faktörlerinin araştırılması. Mikrobiyol Bul 2010; 44(4): 605-17
  7. Saran B, Karahan ZC, Agirbasli H, Tekeli A, Aksoy AM. Candida albicans klinik izolatlarının “randomly amplified polymorphic DNA” yöntemiyle genotiplendirilmesinde kullanılan farklı primerlerin karşılaştırılması. Mikrobiyol Bul 2008; 42(4): 645-54
  8. Chen KW, Lo HJ, Lin YH, Li SY. Comparison of four molecular typing methods to assess genetic relatedness of Candida albicans clinical isolates in Taiwan. J Med Microbiol 2005; 54(Pt 3): 249-58
  9. Costa-de-Oliveira S, Sousa I, Correia A, et al. Genetic relatedness and antifungal susceptibility profile of Candida albicans isolates from fungaemia patients. Med Mycol 2011; 49(3): 248-52
  10. Marol S, Yucesoy M. Molecular epidemiology of Candida species isolated from clinical specimens of intensive care unit patients. Mycoses 2008; 51(1): 40-9
  11. Karkowska-Kuleta J, Rapala-Kozik M, Kozik A. Fungi pathogenic to humans: molecular bases of virulence of Candida albicans, Cryptococcus neoformans and Aspergillus fumigatus. Acta Biochim Pol 2009; 56(2): 211-24
  12. Dağdeviren M, Çerikçioğlu N, Karavuş M. Hastanede yatan fungemili hastalardan izole edilen Candida parapsilosis kökenlerinin virülans faktörleri. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2003; 33(4): 315-22
  13. Birinci A, Cihan CC, Bilgin K, Acuner C, Durupınar B. Değişik klinik örneklerden izole edilen Candida türleri