AI Summary & Key Takeaways
AI InsightAccording to the results, susceptibility rates of isolates against amikacin (100%) and trimethoprim-sulfamethoxazole (63.09%) were identical in both standards.
📌 3 Key Takeaways
Abstract
Determination of treatment protocols for infections according to antimicrobial susceptibility test (AST) results is are important for controlling the problem of antibiotic resistance. Two standards are widely used in the world. One of them is Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI) standards used in Turkey for many years and the other is the European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) standards which is used in European Union member countries and came into use in 2015 in Turkey. Since the EUCAST standards had higher clinical sensitivity limits particularly for gram-negative bacilli compared to CLSI (2009) standards, there will be some changes in antibiotic resistance profi les of Turkey with the use of EUCAST. CLSI has changed zone diameters after 2009 versions and the differences between the two standards were brought to a minimum level. Knowledge of local epidemiological data is important to determine empirical therapy which will be used in urinary tract infections (UTI). The aim of this study was to determine the differences of antibiotic susceptibility zone diameters based on our local epidemiological data among uropathogenic Escherichia coli isolates according to EUCAST 2014 and CLSI 2014 standards. A total of 298 E.coli strains isolated from urine samples as the cause of uncomplicated acute UTI agents, were included in the study. Isolates were identifi ed by conventional methods and with BBL Crystal E/NF ID System (Becton Dickinson, USA). AST was performed with Kirby Bauer disk diffusion method and results were evaluated and interpreted according to the CLSI 2014 and EUCAST 2014 standards. According to the results, susceptibility rates of isolates against amikacin (100%) and trimethoprim-sulfamethoxazole (63.09%) were identical in both standards. However, statistically signifi cant differences were observed between CLSI and EUCAST standards in terms of susceptibilities against gentamicin (91.95% and 84.56%, respectively; p= 0.004), cefuroxime axetil (20.13% and 77.18%, respectively; p= 0.000) and levofl oxacin (73.83% and 67.11%, respectively; p= 0.044). No statistically differences between two standards for ampicillin (32.89% and 36.24%, respectively; p= 0.219), ampicillin-sulbactam (65.77% and 69.13%, respectively; p= 0.216), ciprofl oxacin (72.48% and 71.14%, respectively; p= 0.392) and imipenem (94.63% and 95.30%, respectively; p= 0.426) were determined. In this transitional period, continuity of cooperation between the clinician and microbiology laboratory should be kept forefront and the maintenance of local surveillance studies should be provided by taking into account the changes in antibiotic susceptibility results
Özet
Antimikrobiyal duyarlılık testleri (ADT) sonuçlarına göre enfeksiyonların tedavi protokollerinin belirlenmesi, antibiyotik direnç sorununun kontrol altına alınmasında önemlidir. ADT için dünyada yaygın olarak kullanılan iki standart mevcuttur. Bu standartlardan biri, yıllardır ülkemizde kullanılan "Clinical Laboratory Standards Institute" (CLSI), diğeri ise Avrupa Birliği'ne üye birçok ülkede kullanılan ve 2015 yılında ülkemizde kullanıma giren "European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing" (EUCAST) standartıdır. EUCAST standartlarının ülkemizde kullanıma girmesi ile muhtemel direnç profi llerinde bazı değişiklikler olabilecektir. Bunun nedeni EUCAST standartlarının, CLSI (2009) standartları ile kıyaslandığında özellikle gram-negatif basillerde daha yüksek klinik duyarlılık sınır değerlerine sahip olmasıdır. CLSI 2009 yılından sonraki sürümlerinde zon çaplarında büyük değişikliklere gitmiş ve iki standart arasındaki farklılıklar asgari düzeye indirilmiştir. Bilindiği üzere, üriner sistem enfeksiyonu (ÜSE) için kullanılan ampirik tedavinin belirlenmesinde, lokal epidemiyolojik verilerin önemi büyüktür. Bu çalışmada, ÜSE etkeni Escherichia coli izolatlarının, mevcut antibiyotik duyarlılık zon çaplarının, iki standarda göre lokal epidemiyolojik verilerdeki farklılıklarının belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışmaya, komplike olmayan akut ÜSE etkeni olarak izole edilen 298 E.coli suşu dahil edilmiştir. İzolatların tanımlanmasında konvansiyonel yöntemler ve BBL Crystal E/NF ID System (Becton Dickinson, USA) kullanılmıştır. Antibiyotik duyarlılık testleri Kirby Bauer disk difüzyon yöntemiyle çalışılmıştır. İzolatların antibiyotik duyarlılık testi zon çapları CLSI 2014 ve EUCAST 2014 standartlarına göre değerlendirilmiştir. Yapılan değerlendirmede, amikasin (%100) ve trimetoprim-sülfametoksazol (%63.09) duyarlılık oranlarının her iki standarda göre de aynı olduğu bulunmuştur. Buna karşın CLSI ve EUCAST'e göre duyarlılık oranları, gentamisin (sırasıyla, %91.95, %84.56; p= 0.004), sefuroksim aksetil (sırasıyla, %20.13, %77.18; p= 0.000) ve levofl oksasin (sırasıyla, %73.83, %67.11; p= 0.044) için istatistiksel olarak anlamlı düzeyde farklılıklar göstermiştir. Ampisilin (sırasıyla, %32.89, %36.24; p= 0.219), ampisilin-sulbaktam (sırasıyla, %65.77, %69.13; p= 0.216), siprofl oksasin (sırasıyla, %72.48, %71.14; p= 0.392) ve imipenem (sırasıyla, %94.63, %95.30; p= 0.426) için ise duyarlılık oranları arasında bulunan farklılıklar istatistiksel olarak anlamlı değildir. Bu geçiş sürecinde, antibiyotik duyarlılık oranlarındaki değişimler dikkate alınarak, klinisyen ile mikrobiyoloji laboratuvarı arasındaki işbirliği ön planda tutulmalı ve lokal sürveyans çalışmalarının sürekliliği sağlanmalıdır