Journals / Mikrobiyoloji Bülteni / 2019 / Cilt: 53 - Sayı: 1

Evaluation of Blood Culture Practices: Use of System (Epicenter) Data

Kan Kültürü Uygulamalarının Değerlendirilmesi: İşletim Sistemi (Epicenter) Verilerinin Kullanımı

Pages
12–21
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

In addition, errors at the preanalytical, analytical and postanalytical periods (taking samples, loading bottles into the system and processing positive blood cultures) should be eliminated.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Sepsis is a serious clinical problem and estimated to be responsible for 18 million annual deaths worldwide.
📊
Key Findings & Data:We have examined the collection practices and techniques at four different hospitals, and a total of 165.443 blood culture bottles were evaluated (2013-2015).
💡
Conclusion & Impact:In addition, errors at the preanalytical, analytical and postanalytical periods (taking samples, loading bottles into the system and processing positive blood cultures) should be eliminated.
🔬Design:Research Article
📍Scope:2013-2015 Verileri
⚙️Variables:Domain Parameters

Abstract

Sepsis is a serious clinical problem and estimated to be responsible for 18 million annual deaths worldwide. Therefore, the use and the rapid processing of blood cultures are important for the transition from empiric therapy to directed therapy. The aim of this study was to assess the best blood culture practices in Turkey. We have examined the collection practices and techniques at four different hospitals, and a total of 165.443 blood culture bottles were evaluated (2013-2015). At the preanalytical phase most of the data which were important and which could support hospital quality systems/practices were not entered into the HIS and EpiCenter system. At the analytical phase loading of the bottles and removal of positive bottles primarily occurred between 6:00 and 9:00 AM but the positivity rate of the bottles showed a homogeneous distribution throughout the day. In other words, there were significant delays at processing positive blood culture bottles related to laboratory workers. The effect of education regarding best practices, transition from single bottle to two bottle cultures was successful in all hospitals. Single bottle usage decreased below 10% in all hospitals. Significantly more positive cultures were detected at multiple cultures when compared with the single bottle collection practice. In retrospective patient records, it was seen that all the laboratories reported the results of Gram staining to the clinics. However, these data were not recorded to the EpiCenter. The contamination rates of Ankara Numune Hospital and Akdeniz University Faculty of Medicine Hospital are 6.2% and 5.4% respectively, contamination rates were not reported in other hospitals. The most common isolates detected in blood cultures were Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, and Acinetobacter baumannii. The mean time for the detection of these organisms were less than 20 hours in the aerobic bottle and anaerobic bottles. A total of 79.6% of facultative anaerobic isolates were detected in both bottles; 9.8% were detected only in the aerobic bottles; 10.6% of the isolates were detected only in the anaerobic bottles. As a result, the educational efforts in Turkey have met with success for transition from collecting single bottle blood culture sets to two bottle blood cultures. However, further efforts are needed to increase the number of blood culture sets collected during a 24 hours’ period. In addition, errors at the preanalytical, analytical and postanalytical periods (taking samples, loading bottles into the system and processing positive blood cultures) should be eliminated.

Özet

Sepsis, dünya çapında yılda 18 milyon ölümden sorumlu olduğu tahmin edilen ciddi bir klinik sorundur. Bu nedenle, kan kültürlerinin hızlı bir şekilde işlenmesi, ampirik tedaviden yönlendirilmiş tedaviye geçiş için önemlidir. Bu çalışmanın amacı, Türkiye’deki kan kültürü uygulamalarını değerlendirmektir. Türkiye’deki dört farklı hastanede (2013-2015) toplam 165.443 kan kültürü örneğinde kültürün toplanma ve uygulama süreçleri değerlendirilmiştir. Analiz öncesi dönemde önemli olan ve hastane kalite sistemlerini/uygulamalarını destekleyebilen verilerin çoğu HBS ve kan kültürü işletim sistemine (EpiCenter) girilmemiştir. Analitik dönemde şişelerin özellikle 06:00-09:00 saatleri arasında sisteme yüklendiği ve pozitif şişelerin sistemden çıkarıldığı ve şişelerin pozitifliklerin ise gün içerisinde homojen bir dağılım gösterdiği saptanmıştır. Başka bir deyişle, laboratuvar çalışanlarıyla ilgili pozitif kan kültürü şişelerinin işlenmesinde önemli gecikmeler saptanmıştır. Doğru uygulamalar konusunda verilen eğitimin sonucunda tek şişeden iki şişelik set kullanımına başarılı bir geçiş sağlanmış ve tek şişe kullanımı %10’un altına inmiştir. Tekli şişe alımı ile karşılaştırıldığında çok daha fazla pozitiflik tespit edilmiştir. Retrospektif hasta kayıtlarında, tüm laboratuvarların Gram boyama sonuçlarını kliniklere bildirdiği ancak, bu verilerin EpiCenter’a kaydedilmediği saptanmıştır. Kan kültürü kontaminasyon düzeylerini Ankara Numune Hastanesi %6.2, Akdeniz Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi ise %5.4 olarak bildirirken, diğer hastanelerde kontaminasyon oranları bildirilmemiştir. Kan kültürlerinde en sık olarak Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus ve Acinetobacter baumannii türleri saptanmıştır. Aerobik ve anaerobik şişelerde bu organizmalar için ortalama üreme süresinin 20 saatten az olduğu saptanmıştır. Fakültatif anaerobik izolatların %79.6’sı aerobik/anaerobik şişelerin her ikisinde de ürerken, %9.8’i sadece aerobik şişede; %10.6’sı sadece anaerobik şişede üremiştir. Sonuç olarak, Türkiye’deki eğitim çalışmaları ile tek şişe yerine iki şişelik kan kültürü setlerine geçişte başarı sağlanmıştır. Bununla birlikte, 24 saat boyunca toplanan kan kültürü gruplarının sayısını arttırmak için daha fazla çaba gerekmektedir. Bunun yanında, preanalitik, analitik ve postanalitik safhalarda örneklerin alınması, şişelerin sisteme yüklenmesi ve pozitif kan kültürlerinin işlenmesiyle ilgili hatalar gecikmeler ortadan kaldırılmalıdır.

🔖

Cite This Article

BAŞUSTAOĞLU, A., YILDIZ, S. S., MUMCUOĞLU, I. İ., KARAHAN, Z. C., ÖĞÜNÇ, D., KALELİ, İ., KURŞUN, Ş., EVREN, E., BAYSAL, B. Ö., DEMİR, M., MURRAY, P. (2019). Evaluation of Blood Culture Practices: Use of System (Epicenter) Data. Mikrobiyoloji Bülteni, Cilt: 53 - Sayı: 1, 12–21. https://ajindex.com/articles/298294

References (15)

  1. Dellinger RP, Levy MM, Carlet JM, Bion J, Parker MM, Jaeschke R, et al. Surviving Sepsis Campaign: International guidelines for management of severe sepsis and septic shock: 2008. Crit Care Med 2008;36(1):296-327
  2. Beekmann SE, Diekema DJ, Chpin KC, Doern GV. Effects of rapid detection of bloodstream infections on length of hospitalization and hospital charges. J Clin Microbiol 2003;41(7):3119-25
  3. Kumar A, Ellis P, Arabi Y, Roberts D, Light B, Parrillo JE, et al. Initiation of inappropriate antimicrobial therapy results in a fivefold reduction of survival in human septic shock. Chest 2009;136(5):1237-48
  4. CLSI, Principles and Procedures for Blood Cultures; Approved Guideline, M47-A 2007;27:17
  5. Baron EJ, Weinstein MP, Dunne WD, Yagupsky P, Welch DF, Wilson DM. Cumitech Cumulative techniques and Procedures in Clinical Microbiology Blood Cultures IV, 2005. ASM Press, Washington DC
  6. Tıbbi Mikrobiyoloji Uzmanları için, Klinik Örnekten Sonuç Raporuna Uygulama Rehberi; Kan Dolaşımı Örnekleri, 2017, Ankara. 7. https://kalite.saglik.gov.tr/content/files/duyurular_2011/2011/2014/21072015_gosterge_yonetimi_ rehberi_1.pdf (Erişim tarihi: 22.09.2017)
  7. EpiCenter System V6.60 User Manual
  8. Chiarini A, Palmeri A, Amato T, Immordino R, Distefano S, Giammanco A. Detection of bacterial and yeast species with the Bactec 9120 automated system with routine use of aerobic, anaerobic, and fungal media. J Clin Microbiol 2008;46(12):4029-33
  9. Grohs P, Maniardi JL, Podglajen I, Hanras X, Eckert C, Buu-Hoi A, et al. Relevance of routine use of the anaerobic blood culture bottle. J Clin Microbiol 2007;45:2711-5
  10. Akyar I, Yaman G. Anaerop kan kültür şişelerinin rutin kullanımının değerlendirilmesi. ACU Sağlık Bil Derg 2011;2(3):141-5
  11. Passarini R, Cassatella MC, Salvatici M, Bottari F, Mauro C, Radice D, et al. Recovery and time to growth of isolates in blood culture bottles: comparison of BD Bactec Plus Aerobic/F and BD Bactec Plus Anaerobic/F bottles. Scan J Infect Dis 2014;46(4):288-93
  12. Hollick GE, Edinger R, Martin B. Clinical comparison of the BACTEC 9000 standard anaerobic/F and lytic/F blood culture media. Diagn Microbiol Infect Dis 1996;24(4):191-6
  13. Weinstein PM. Blood Culture Contamination: Persisting problems and partial progress. J Clin Microbiol 2003;41(6):2275-8
  14. Balıkçı A, Belas Z, Topkaya AE. Kan kültürü pozitifliği: etken ya da kontaminasyon mu? Mikrobiyol Bul 2013;47(1):135-40
  15. Trautner BW, Clarridge JE, Darouiche RO. Ski