AI Summary & Key Takeaways
AI InsightAs a result, nine-year results of the mycobacteriology laboratory in our region were analyzed and the MTC and NTM epidemiological data were determined for the first time.
📌 3 Key Takeaways
Abstract
Tuberculosis (TB) continues to pose a significant public health problem worldwide. For mycobacterio-logy laboratories, it is important to be able to diagnose active cases and to make a differential diagnosis of non-tuberculous mycobacteria (NTM). In this study, it was aimed to retrospectively evaluate the epide-miological status of the Mycobacterium [Mycobacterium tuberculosis complex (MTC) and NTM] obtained from the clinical specimens of patients with TB suspicion, and the resistance rates of MTC isolates against anti-TB drugs. Various clinical samples of TB suspected patients sent to the Balıkesir Atatürk City Hospital Mycobacteriology Laboratory between 2011 and 2019, were included in the study. Microscopy, culture procedures, and the first-line anti-TB drug susceptibility tests were performed according to the instruc-tions. Identification of NTM at the species level could be made during four years including 2012, 2013, 2016, and 2017. In our study, acid fast bacillus (AFB) positivity rate was 4% (1.867/47.235); the culture positivity rate for MTC was 5.1% (1.576/31.017) and 1.1% (333/31.017) for NTM. AFB positivity was detected in 837 (53.1%) of the clinical specimens isolated from MTC. In the presence of AFB positivity, it was determined that bacterial growth was significantly higher in both liquid culture systems (LCS) and Lowenstein-Jensen (LJ) media. The isolation rate of MTC isolates from LCS was determined as 95.3% (1.503/1.576) and the isolation rate from LJ was 67.4% (1.063/1.576). The bacterial growth rate was fo-und to be significantly higher in LCS. The average bacterial growth time (ABGT) of AFB negative samples were 21.79 ± 9.96 days; 13.74 ± 8.13 days for AFB positive samples, and ABGT was significantly shorter in the case of AFB positivity. As the severity of AFB positivity increased, ABGT wasshortened which was statistically significant. While 783 (78%) of the isolates were found to be sensitive to all the tested drugs, 221 (22%) were found to be resistant to at least one drug. Eleven of them (1%) were identified as multi-drug resistant-TB (MDR-TB) isolates. In our study, 16 different species were identified among 112 typed NTM isolates. Mycobacterium gordonae (25.0%), Mycobacterium avium complex (17.0%) (Mycobacterium intracellulare-11.6%, Mycobacterium avium-5.4%) and Mycobacterium abscessus (13.3%) were the most frequently isolated NTM species. As a result, nine-year results of the mycobacteriology laboratory in our region were analyzed and the MTC and NTM epidemiological data were determined for the first time.
Özet
Tüberküloz (TB) tüm dünyada önemli bir halk sağlığı sorunu oluşturmaya devam etmektedir. Mikobak-teriyoloji laboratuvarları için aktif olgulara tanı konulabilmesi ve tüberküloz dışı mikobakteri (TDM)’lerin ayırıcı tanısının yapılabilmesi önemlidir. Bu çalışmada, TB şüpheli hastaların klinik örneklerinden, boyalı mikroskobik inceleme ve kültür yöntemleriyle elde edilen mikobakterilere ait [Mycobacterium tuberculosiskompleks (MTK) ve TDM] epidemiyolojik durumun ve MTK izolatlarının birinci seçenek anti-TB ilaçlara karşı direnç oranlarının retrospektif olarak değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Çalışmaya, 2011-2019 yıl-ları arasında Balıkesir Atatürk Şehir Hastanesi Mikobakteriyoloji Laboratuvarına gönderilen TB şüpheli hastalara ait çeşitli klinik örnekler dahil edilmiştir. Mikroskopi, kültür işlemleri ve birinci seçenek anti-TB ilaç duyarlılık testleri talimatlara göre uygulanmıştır. TDM’lerin tür düzeyinde tanımlanması 2012, 2013, 2016, 2017 yıllarını içeren dört yıllık sürede dış merkez desteği ile gerçekleştirilmiştir. Çalışma-mızda aside dirençli basil (ARB) pozitiflik oranı %4 (1.867/47.235), MTK için kültür pozitiflik oranı %5.1 (1.576/31.017), TDM’ler için kültür pozitiflik oranı ise %1.1 (333/31.017) olarak saptanmıştır. MTK izole edilen klinik örneklerin 837 (%53.1)’sinde ARB pozitifliği görülmüştür. ARB pozitifliği varlığında hem sıvı kültür sistemleri (SKS) hem de Löwenstein-Jensen (LJ)’de üremenin anlamlı olarak daha yüksek olduğu belirlenmiştir. MTK izolatlarının SKS’den izolasyon oranı %95.3 (1.503/1.576), LJ’den izolasyon oranı ise %67.4 (1.063/1.576) olarak saptanmıştır. SKS’de üremenin anlamlı olarak daha yüksek olduğu tespit edilmiştir. ARB negatif örneklerin ortalama üreme zamanı (OÜZ) 21.79 ± 9.96 gün, ARB pozitif örnekle-rin OÜZ ise 13.74 ± 8.13 gün olarak saptanmış ve ARB pozitifliğinde OÜZ’nin anlamlı olarak daha kısa olduğu belirlenmiştir. ARB pozitifliğinin şiddeti arttıkça istatistiksel olarak anlamlı şekilde OÜZ’nin kısaldığı gözlenmiştir. İzolatların 783 (%78)’ü test edilen tüm ilaçlara duyarlı bulunurken, 221 (%22) izolat en az bir ilaca dirençli bulunmuştur. Bunlardan 11 (%1)’i, çok ilaca dirençli-TB (ÇİD-TB) izolatı olarak belirlen-miştir. Çalışmamızda tiplendirilen 112 TDM izolatı için 16 farklı tür tanımlanmıştır. En sık izole edilen TDM türleri Mycobacterium gordonae (%25), Mycobacterium avium kompleks (%17.0) [Mycobacterium intracel-lulare (%11.6), Mycobacterium avium (%5.4)] ve Mycobacterium abscessus (%13.3) olarak belirlenmiştir. Sonuç olarak, bu çalışma ile bölgemizdeki mikobakteriyoloji laboratuvarının dokuz yıllık sonuçları analiz edilerek ilk defa MTK ve TDM epidemiyolojik verileri belirlenmiştir.