Journals / Online Türk Sağlık Bilimleri Dergisi / 2020 / Cilt: 5 - Sayı: 1

Antibiotic Susceptibility of Escherichia coli Strains Isolated From Urine Cultures in Karabuk Province and Surrounding Region

Karabük İli ve Çevresinde İdrar Kültürlerinden İzole Edilen EscherichiacoliSuşlarının Antibi-yotik Duyarlılıkları

Pages
17–24
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

In our study, we found that amikacin, gentamicin, imipenem, meropenem, nitrofurantoin and fosfomycin should be preferred for empirical treatment of urinary tract infections in our region

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Objective: Urinary tract infections (UTI) are the most common bacterial infections and Escherichia coli (E.coli) is the most isolated pathogen from UTI.
📊
Key Findings & Data:Materials and Methots: In this study 21488 urine cultures of the patients who admitted to various departments between April 2016 and December 2017 were evaluated retrospectively.
💡
Conclusion & Impact:In our study, we found that amikacin, gentamicin, imipenem, meropenem, nitrofurantoin and fosfomycin should be preferred for empirical treatment of urinary tract infections in our region
🔬Design:Research Article
📍Scope:2016 Verileri
⚙️Variables:Domain Parameters

Abstract

Objective: Urinary tract infections (UTI) are the most common bacterial infections and Escherichia coli (E.coli) is the most isolated pathogen from UTI. In this study we aimed to evaluate antibiotic susceptibility profiles of E.coli strains isolated from urine cultures and to determine appropriate alternatives of empirical treatment in our region. Materials and Methots: In this study 21488 urine cultures of the patients who admitted to various departments between April 2016 and December 2017 were evaluated retrospectively. Automated system Phoenix™ (Becton Dickinson Diagnostics, USA) was used for identification and antibiotic susceptibility testing of bacteria obtained from urine cultures. A total of 2265 E.coli strains were identified belonging to 1875 outpatients and 390 inpatients. Results: Antibiotic sensitivity rates were detected for E.coli isolated from outpatients as 99.2% to amikacin, 98.4% to imipenem, 97.6% to nitrofurantoin, 97.3% to meropenem, 96.8% to fosfomycin and 84.4% to gentamicin; from inpatients as 99.1% to amikacin, 96.6% to imipenem, 96.5% to fosfomycin, 95.7% to nitrofurantoin, 93.1% to meropenem and 82.2% to gentamicin. Conclusion: Regional antibiotic resistance monitoring is essential in order to guide empirical therapy. Thus, thetreatment of the patients will be done effectively and the loss of time and cost resulting from inappropriate empirical treatment will be prevented. In our study, we found that amikacin, gentamicin, imipenem, meropenem, nitrofurantoin and fosfomycin should be preferred for empirical treatment of urinary tract infections in our region

Özet

Amaç:Üriner sistem enfeksiyonları (ÜSE) bakteriyel en-feksiyonlar arasında en yaygın olanıdır ve bu enfeksiyon-larda en sık izole edilen etken Escherichia coli (E.coli)’dir. Biz bu çalışmada, idrar kültüründe E.coli üreyen suşların antibiyotik duayarlılıklarını değerlendire-rek bölgemiz için uygun ampirik tedavi seçeneklerini saptamayı amaçladık. Materyal ve Metot: Bu çalışmada Nisan 2016 - Aralık 2017 tarihleri arasında çeşitli poliklinik ve servislerden gön¬derilen 21488 idrar kültürü retrospektif olarak ince-lendi. İdrar kültürlerinden izole edilen bakterilerin tanım-lanması ve antibiyotik duyarlılık testleri için Phoenix ™ (Becton Dickinson Diagnostics, ABD) otomatize sistem kullanıldı. 1875 poliklinik ve 390 servis hastasından to-plam 2265 E.coli suşu izole edildi. Bulgular: Poliklinik hastalarından izole edilen suşların amikasine %99,2, imipeneme %98.4, nitrofurantoine %97,6, meropeneme %97,3, fosfomisine %96,8 ve gentam-isine %84,4; servis hastalarından izole edilenlerin ise ami-kasine %99,1, imipeneme %96,6, fosfomisine %96,5, nitrofurantoine %95,7, meropeneme %93,1 ve gentam-isine %82,2 oranında duyarlı oldukları saptandı. Sonuç: Bölgesel antibiyotik direnç oranlarının izlenmesi ampirik tedaviye yön vermek açısından gereklidir. Böylece hem hastanın tedavisi etkin bir şekilde yapılacak hem de uygun olmayan ampirik tedaviden kaynaklanan zaman ve maliyet kaybının önüne geçilmiş olacaktır. Çal-ışmamızda bulduğumuz sonuçlara göre amikasin, gentam-isin, imipenem, meropenem, nitrofurantoin ve fosfomisi-nin bölgemizdeki üriner sistem enfeksiyonlarının ampirik tedavisinde öncelikle tercih edilmesi gerektiği kanaatind-eyiz.

🔖

Cite This Article

KURU, C., ÇAKMAKLIOĞULLARI, E. K. (2020). Antibiotic Susceptibility of Escherichia coli Strains Isolated From Urine Cultures in Karabuk Province and Surrounding Region. Online Türk Sağlık Bilimleri Dergisi, Cilt: 5 - Sayı: 1, 17–24. https://ajindex.com/articles/293888

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (14)

  1. Doğru A, Karatoka B. The resistance rates of urinary tract infections: Our data from year 2010. Turkish journal of urology. 2013;39 (4):237-243
  2. Çalışkan E, Dede A. Ayaktan başvuran hastalarda üriner sistem infeksiyonuna neden olan Esherichia coli ve Klebsiella spp. suşlarının çeşitli antibiyotiklere direnç oranlarının ve genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz varlığının değerlendirilmesi. ANKEM Derg. 2015;29 (2):47-53
  3. Schito GC, Naber KG, Botto H et al. The ARESC study: an international survey on the antimicrobial resistance of pathogens involved in uncomplicated urinary tract infections. International Journal of Antimicrobial Agents. 2009;34(5):407-413
  4. Wagenlehner FM, Wullt B. Antimicrobials in urogenital infections. International Journal of Antimicrobial Agents. 2011;38S:3-10
  5. Aykan ŞB, Ciftci İH. Türkiye’de İdrar Kültürlerinden İzole Edilen Escherichia coli Suşlarının Antibiyotiklere Direnç Durumu: Bir Meta-Analiz. Mikrobiyol Bul. 2013;47(4): 603- 618
  6. Hoban DJ, Nicolle LE. Antimicrobial susceptibility of global inpatient urinary tract isolates of Escherichia coli: results from the Study for Monitoring Antimicrobial Resistance Trends (SMART) program: 2009–2010. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease. 2011;70(4):507-511
  7. Alos JI, Serrano MG. Antibiotic resistance of Escherichia coli from community-acquired urinary tract infections in relation to demographic and clinical data. Clin Microbiol Infect. 2005;11:199-203
  8. The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters. Version 6.0;2016
  9. Allocati N, Masulli M. Escherichia coli in Europe: An Overview. Int J Environ Res Public Health. 2013;10(12):6235-6254
  10. Rosenberg M. Pharmacoeconomics of treating uncomplicated urinary tract infections. Int J Antimicrob Agents.1999;11:247-251
  11. Demirtürk N, Demirdal T. İdrar örneklerinden izole edilen bakterilerin antibiyotiklere duyarlılıkları. Türk Mikrobiyol Cem Derg. 2005;35:103-106
  12. Eroğlu M, Koçoğlu E. Toplum kaynaklı erişkin üriner sistem enfeksiyonlarında izole edilen Enterobactericeae türlerinin bazı antibiyotiklere duyarlılıkları: geriye dönük çalışma. Türk Üroloji Derg. 2007;33(1):100-103
  13. Kibar F, Yaman A. İdrar örneklerinden izole edilen bakteriler ve antibiyotiklere duyarlılıkları. Türk Mikrobiyol Cem Derg. 2004;34:162- 170
  14. Aşgın N, Cakmaklıoğulları EK. In-vitro antibiotic resistance profile of E.coli strains isolated from communit