Journals / Erciyes Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Fen Bilimleri Dergisi / 2014 / Cilt: 30 - Sayı: 2

Prevalence of Sharka (Plum Pox Virus) in Kayseri

Kayseri’de yüksek şarka enfeksiyonu

Pages
80–85
Publication Date
2014-04-01
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

RT PCR results suggested that all positive samples are PPV-M.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Sharka cuased by Plum Pox virus is the most detrimental disease of stone fruits.
📊
Key Findings & Data:In Yahyalı, 10 samples including symptomless samples in an infected plum orchard were collected.
💡
Conclusion & Impact:RT PCR results suggested that all positive samples are PPV-M.
🔬Design:Survey & Empirical Study
📍Scope:10 samples
⚙️Variables:Şarka hastalığı · Plum pox virus · DASI-ELISA

Abstract

Sharka cuased by Plum Pox virus is the most detrimental disease of stone fruits. Existence of PPV in Kayseri was reported previously. However prevalence of PPV was unknown to the date. Surveys were conducted and symptoms on stone fruits wereobserved to determine andassessthe prevalence of Sharka disease in Kayseri. Fifty three samples showing the symptoms in Kayseri city center were collected randomly. In Yahyalı, 10 samples including symptomless samples in an infected plum orchard were collected. Double Antibody Sandwich Indirect-ELISA (DASI-ELISA) and Reverse Transcriptase (RT) PCR were performed to test the virus existence. PPV-D (Dideron) subgrouping with PPV-D specific antibody 4D and primer pairs P1/ PDand PPV-M (Marcus) subgrouping with M specific AL antibody and primer pairs P1/ PM was conducted. In Kayseri city center, 47 samples (89%) were found to be PPV infected. RT PCR results suggested that all positive samples are PPV-M. However, Of the 47 positive samples 33 reacted both against to PPM-D and PPV-M specificantibodies. Previous researches showed that some of this kind of ambiguous isolates could be PPV-T (Turkey). The diseasewere determined first time in a seven years old plum orchard in Yahyalı. The prevalence of PPV in Kayseri were found to be high suggesting that the disease in exist in Kayseri for a long time.

Özet

Şarka (Plum Pox Virüsü-PPV) sert çekirdekli meyvelerin en önemli hastalığıdır. PPV’nin Kayseri’de bulunduğu rapor edilmiş ise de yaygınlığı üzerine çalışma yapılmamıştır. Şarka semptomları Kayseri’de yetişen sert çekirdekli meyvelerde gözlenmiştir. Kayseri il merkezinde 53, Yahyalı’da ise 10 ağaçtan örnek toplanmıştır. DASI-ELİSA (Double Antibody Sandwich Indirect-ELISA) yöntemi ve RT (Revers Transkriptaz) PCR ile örneklerde virüsün varlığı testlenmiştir. PPV-M (Markus) spesifik antiserum-AL ve P1/PM primeri kullanılarak, PPV-D (Dideron) spesifik antiserum 4D ve P1/ PD primer çifti kullanılarak PPV-M ve PPV-D ırk gruplaması yapılmıştır. RT PCR çalışmaları sonucunda Kayseri il merkezinde 47 (%89) örneğin Plum Pox Virüsü ile bulaşık olduğu bulunmuştur. RT PCR çalışmaları izolatların PPV-M ırkı olduğuna işaret etmektedir. Serolojik testlemede 33 örnek M spesifik antiserumun yanı sıra D sipesifik antiserum ile de reaksiyon göstermiştir. Benzer durumlarda yapılan detaylı çalışmalar böyle isolatların PPV-T (Turkey) olabileceği göstermiştir. Hastalık Yahyalı’da ki bir erik bahçesinde ilk defa tespit edilmiştir. Kayseri ilmerkezinin Şarka ile yoğun olarak bulaşık olduğu belirlenmiş ve dolayısıyla hastalığın Kayseri il merkezinde uzun süredir var olduğu sonucuna varılmıştır.

🔖

Cite This Article

CEYLAN, A., GÜRCAN, K., AKBULUT, M., GHADERİ, M. (2014). Prevalence of Sharka (Plum Pox Virus) in Kayseri. Erciyes Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Fen Bilimleri Dergisi, Cilt: 30 - Sayı: 2, 80–85. https://ajindex.com/articles/253113

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (14)

  1. Glasa, M., Malinowski, T., Predajna, L., Pupola, N., Dekena, D., Michalczuk, L., and Candresse, T., Sequence Variability, Recombination Analysis, and Spesific Detection of the W Strain of Plum Pox virus, the American Phytopahological Society, Vol 101, No. 8, p 980-985, 2011.
  2. Cambra, M., Capote, N., Myrta, A., Llácer, G.,Plum Pox Virus And The Estimated Costs Associated With Sharka Disease. EPPO Bull 36: 202–204, 2006.
  3. Maejima, K., Himeno, M., Komatsu, K.,Takinami, Y., Hashimoto, Takahashi, S., Yamaji, Y., Oshima, K., Namba, S., Molecular Epidemiology of Plum Pox virus in Japan, The American Phytopathological society, Vol. 101, No.5, 2011.
  4. Sahityancı, S., Virus De La Sharka Chez Le Prunier. Bulletin Phytosanitaire FAO 17:69, 1969.
  5. Elibüyük, I. Ö, Natural Spread of Plum pox virus in Ankara, Turkey. J. Phytopathol, 151: 617–619. 2003.
  6. Sertkaya, G, Ulubas, C, Caglayan, K,. Detection and Characterisation of Plum pox virus (PPV) by DAS-ELISA and RT-PCR/RFLP Analysis in Turkey. Turk. J. Agric. For, 27: 213–220, 2003.
  7. Elibüyük, I. Ö, Current Situation of Sharka Disease in Ankara, Turkey. Phytoparasitica, 32: 417–420, 2004.
  8. Elibüyük, I. Ö, Detection of Plum Pox Virus in Ornamental Prunus Cerasifera. Phytoparasitica, 34: 347– 352, 2006.
  9. Koç, G., and Baloğlu, S., Firt Report of Sharka in the Çukurova Region of Turkey. Journal of Plant Pathology, 88, s68, 2006.
  10. Akbaş, B., Değirmenci, K., Çiftçi, O., Kaya, A., Yurtmen, M., Uzunoğulları, N., Çelik, N., and Türkölmez, Ş., Update on Plum pox virus Distribution in Turkey, Phytoparhol. Mediterr. 50, 75-83, 2011.
  11. Koç, G., ve Baloğlu, S., Doğu Akdeniz Bölgesinde Sert Çekirdekli Meyvelerde Plum Pox Potyvirüs (PPV)’ünün Durumunun (Determination and Characterization of Plum pox potyvirus (PPV) on Stone Fruits in Eastern Mediterranean Region). Türkiye IV. Bitki Koruma Kongresi Bildirileri, Kahramanmaraş s71, 2011. ve Karakterizasyonu Ulubaş Serçe, U., Gazel, M., Çağlayan, K.,. Plum pox virus streynlerinin Türkiye’deki Dağılımı (Distribution of Plum pox virus strains in Turkey). Türkiye IV. Bitki Koruma Kongresi Bildirileri, Kahramanmaraş s72, 2011.
  12. Kegler, H., Fuchs, E., Grüntzing, M., Schwarz, S., Some Results of 50 Years of Research on the Resistance to Plum pox virus, Acta Virol. 42, 200-215, 1998.
  13. Kerlan, C., Dunez, J., Some Properties of Plum pox virus and Its Nucleic Acid And Protein Components. Acta Hort. 67, 185-192, 1976.
  14. Wetzel, T., Candresse, T., Ravelonandro, M., and Dunez, J., A Polymerase Chain Reaction Assay Adapte