Journals / Gülhane Tıp Dergisi / 2009 / Cilt: 51 - Sayı: 3

Investigation of adenovirus in primary school-age children with the symptoms of upper respiratory tract infection using polymerase chain reaction

Üst solunum yolu enfeksiyonu yakınmaları olan ilköğretim çağı çocuklarında polimeraz zincir reaksiyonu yöntemi kullanılarak adenovirus araştırılması

Pages
162–167
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

However, data on viral respiratory infections in primary school-age children in Turkey are still unknown, and further studies in larger populations are needed on this subject.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Adenoviruses, being the common cause of common cold are the viruses which affect many systems and result in various disease presentations in the human and are common in the worldwide.
📊
Key Findings & Data:Of five hundred specimens, 11 (2.2%) were positive for adenovirus.
💡
Conclusion & Impact:However, data on viral respiratory infections in primary school-age children in Turkey are still unknown, and further studies in larger populations are needed on this subject.
🔬Design:Research Article
📍Scope:11 specimens
⚙️Variables:Domain Parameters

Abstract

Adenoviruses, being the common cause of common cold are the viruses which affect many systems and result in various disease presentations in the human and are common in the worldwide. The aim of this study was to detect nasopharyngeal adenoviruses and perform subtype identification of virus isolates in primary school-age children. Throat swab samples were collected from the primary school-age children with the symptoms of respiratory tract infection without an epidemic. Polymerase chain reaction with common adenovirus primers was used to detect adenoviruses. Subgroup identification using conventional polymerase chain reaction with group specific primers was made in samples detected positive for adenovirus by polymerase chain reaction. Afterwards whether the products of polymerase chain reaction were specific or not was confirmed by using MspI restriction enzyme. Of five hundred specimens, 11 (2.2%) were positive for adenovirus. All these 11 specimens were positive with subgroup E (serotype 4) specific primers and negative with subgroup B and C specific primers. Subgroup specific polymerase chain reaction products were positive for subgroup E. Infections caused by adenoviruses are usually seen in the early years of life, and limited number of studies in our country have been performed on pre-school children and students. In this study, all the adenovirus strains were identified as subgroup E (serotype 4). However, data on viral respiratory infections in primary school-age children in Turkey are still unknown, and further studies in larger populations are needed on this subject.

Özet

Sıklıkla soğuk algınlığına neden olan adenoviruslar insanlarda pek çok sistemi etkileyen ve çeşitli hastalık tablolarına yol açabilen, dünya genelinde yaygın virüslerdir. Bu çalışmanın amacı, ilkokul çocuklarında nazofarengeal adenovirusları saptamak ve virüslerin alt tip tanımlamasını yapmaktı. Bir salgın olmaksızın solunum yolu enfeksiyon belirtileri olan ilköğretim çağı çocuklarından boğaz sürüntü örnekleri toplandı. Adenovirusların saptanması için genel adenovirus primerleriyle polimeraz zincir reaksiyonu kullanıldı. Polimeraz zincir reaksiyonu ile adenovirus pozitifliği saptanan örneklerin gruba özgü primerlerin kullanıldığı konvansiyonel polimeraz zincir reaksiyonu yöntemiyle alt grup tanımlaması yapıldı. Bundan sonra polimeraz zincir reaksiyonu ürünlerinin özgül olup olmadığı MspI restriksiyon enzimi kullanılarak doğrulandı. Beş yüz örneğin 11'inde (%2.2) adenovirus pozitif bulundu. Bu örneklerin tümü E alt grubuna (Serotip 4) özgü primerlerle pozitif, B ve C alt gruplarına özgü primerlerle negatif bulundu. Alt gruba özgü polimeraz zincir reaksiyonu ürünleri E alt grubu ile uyumlu bulundu. Adenoviruslara bağlı enfeksiyonlar sıklıkla hayatın erken dönemlerinde görüldüğü için, ülkemizdeki kısıtlı sayıdaki çalışmalar daha çok okul öncesi çocuklar ve öğrencilerle ilişkilidir. Bu çalışmada tüm adenovirus suşları E alt grubu (serotip 4) olarak bulundu. Ancak Türkiye'de ilköğretim çağı çocuklarında viral solunum yolu enfeksiyonlarına ait veriler hala bilinmemektedir ve bu konuda daha geniş popülasyonlarla yapılacak çalışmalara gereksinim vardır.

🔖

Cite This Article

BODUR, E., YAPAR, M., ŞENER, K., ÇÖKMÜŞ, C., GÜNEY, Ç., KUBAR, A. (2009). Investigation of adenovirus in primary school-age children with the symptoms of upper respiratory tract infection using polymerase chain reaction. Gülhane Tıp Dergisi, Cilt: 51 - Sayı: 3, 162–167. https://ajindex.com/articles/226158

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (14)

  1. Günaydın M. Adenovirüsler. In: Başustaoğlu A, Kubar A, Yıldıran ŞT, Tanyüksel M. (çeviri eds). Klinik Mikrobiyoloji. 9ncu baskı. Ankara: Atlas Kitapçılık, 2009: 1589-1600
  2. Jong JCD, Wermenbol AG, Uijterwaal MWV, et al. Adenoviruses from human immunodeficiency virus infected individuals, including two strains that represent new candidate serotypes Ad50 and Ad51 of species B and D. J Clin Microbiol 1999; 37: 3940-3945
  3. Hashido M, Mukouyama A, Sakae K, et al. Molecular and serological characterization of adenovirus genome type 7h isolated in Japan. Epidemiol Infect 1999; 122: 281-286
  4. Aydin K, Caylan ÖR. Soğuk Algınlığı. In: Uzun Ö, Ünal S (eds). Güncel Bilgiler Işığında İnfeksiyon Hastalıkları. Ankara: Bilimsel Tıp Yayınevi, 2001: 161-166
  5. Swenson PD, Wadell G, Allard A, Hierholzer JC. Adenoviruses. In: Murray PR, Baron EJ, Pfaller MA, Tenover FC, Yolken RH (eds). Manual of Clinical Microbiology. 8th ed. Washington DC: ASM Press, 2003: 1404-1417
  6. Inagawa WS, Tanaka K, Uchio E, Itoh N, Ohno S, Aoki K. Genome typing of adenovirus type 34 isolated in two cases of conjunctivitis in Sapporo, Japan. J Clin Microbiol 2001; 39: 4187-4189
  7. Inagawa WS, Oshima A, Aoki K, et al. Rapid diagnosis of adenoviral conjunctivitis by PCR and restriction fragment length polymorphism analysis. J Clin Microbiol 1996; 34: 2113-2116
  8. Ishiko H, Shimada Y, Konno T, et al. Novel human adenovirus causing nosocomial infections of epidemic keratoconjunctivitis. J Clin Microbiol 2008; 46: 2002-2008
  9. Sener K, Yapar M, Guney C, et al. Investigation of the presence and subgroups of adenoviruses in nasopharyngeal samples of military recruits with respiratory tract infections. Mikrobiyol Bul 2009; 43: 91-101
  10. Yapar M, Aydogan H, Pahsa A, et al. Rapid and quantitative detection of Crimean-Congo Hemorragic Fever Virus by one step real-time reverse transcriptase PCR. Jpn J Infect Dis 2005; 58: 358-362
  11. Erişim: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/index. html. Son erişim tarihi: 16.03.2005
  12. Emel Bozkaya. Solunum sistemi infeksiyonları ve influenza. In: Ustaçelebi Ş, Abacıoğlu H, Badur S (eds). Moleküler, Klinik ve Tanısal Viroloji. Ankara: Güneş Kitabevi, 2004: 101-111
  13. Kim RM, Lee RH, Lee MG. Epidemiology of acute viral respiratory tract infections in Korean children. J Infect 2000; 41: 152-158
  14. Carballal G, Videla C, Misirlian A, Requeijo PV, Aguilar CM. Adenovirus type 7 associated with severe and fatal acute lower respiratory infections in Argentine