SavedAdd your journal

Journals / Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi / 2018 / Cilt: 24 - Sayı: 6

Çin’de Yaban Domuzunda (Sus scrofa) Astrovirusların Tanımlanması ve Genetik Karakterizasyonu

Identification and Genetic Characterization of Astrovirus in Wild Boar (Sus scrofa) in China

Fan-fan ZHANG
Yu-xin TANG
Yu YE
Nannan GUO
Min ZHANG
Hao LI
Dan LEI
Qiong WU
Dong-yan HUANG
De-ping SONG
Pages
899–903
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

Filogenetik analiz WBAstV/CH/2015’in WBAstV-1/2011/HUN ile yakın akraba olduğunu ve PAstV 4 topluluğuna yakın olarak yer aldığını göstermiştir..

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Domuz astrovirusu (PAstV) dünya çapında ishalli domuzlarda en sıklıkla belirlenen bir virustur.
📊
Key Findings & Data:Astrovirus WBAstV/CH/2015’un tüm genom sekansı amplifiye edildi ve belirlendi.
💡
Conclusion & Impact:Filogenetik analiz WBAstV/CH/2015’in WBAstV-1/2011/HUN ile yakın akraba olduğunu ve PAstV 4 topluluğuna yakın olarak yer aldığını göstermiştir..
🔬Design:Research Article
📍Scope:2015 Verileri
⚙️Variables:Domain Parameters

Abstract

Domuz astrovirusu (PAstV) dünya çapında ishalli domuzlarda en sıklıkla belirlenen bir virustur. Bu çalışmada, Çin’in Jiangxi eyaletinde yaban domuzunda (Sus scrofa) astrovirusun ilk tespiti ve tüm genom sekans analizi gerçekleştirilmiştir. Astrovirus WBAstV/CH/2015’un tüm genom sekansı amplifiye edildi ve belirlendi. Sekans homoloji analizi, WBAstV/CH/2015’in dünye çapında PAstVları ile %40.8 ile %79.7 arasında benzerliğe sahip olduğunu ve Macaristan’da tespit edilen diğer bir yaban domuzu astrovirus (WBAstV) suşu olan WBAstV-1/2011/HUN ile en yüksek benzerliğe (%79.7) sahip olduğunu gösterdi. Filogenetik analiz WBAstV/CH/2015’in WBAstV-1/2011/HUN ile yakın akraba olduğunu ve PAstV 4 topluluğuna yakın olarak yer aldığını göstermiştir..

Özet

Porcine astrovirus (PAstV) is a frequently detected virus in pigs suffering from diarrhea worldwide. Here, we report the first identification and complete genome sequence of astrovirus in wild boar (Sus scrofa) in Jiangxi, China. The complete genome sequence of a representative astrovirus, WBAstV/CH/2015, was amplified and determined. Sequence homology analysis showed that WBAstV/CH/2015 had 40.8% to 79.7% homology with PAstVs worlwide, and shared the highest homology (79.7%) with another wild boar astrovirus (WBAstV) strain WBAstV-1/2011/HUN from Hungary. Phylogenetic analysis showed that WBAstV/CH/2015 was closely related to WBAstV-1/2011/HUN and located in the cluster of PAstV 4.

🔖

Cite This Article

ZHANG, F., TANG, Y., YE, Y., GUO, N., ZHANG, M., LI, H., LEI, D., WU, Q., HUANG, D., SONG, D. (2018). Çin’de Yaban Domuzunda (Sus scrofa) Astrovirusların Tanımlanması ve Genetik Karakterizasyonu. Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, Cilt: 24 - Sayı: 6, 899–903. https://ajindex.com/articles/214434

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (8)

  1. Dennehy PH, Nelson SM, Spangenberger S, Noel JS, Monroe SS, Glass RI: A prospective case-control study of the role of astrovirus in acute diarrhea among hospitalized young children. J Infect Dis, 184 (1): 10-15, 2001. DOI: 10.1086/321007 Padmanabhan A, Hause BM: Detection and characterization of a novel genotype of porcine astrovirus 4 from nasal swabs from pigs with acute respiratory disease. Arch Virol, 161 (9): 2575-2579, 2016. DOI: 10.1007/s00705-016-2937-1
  2. Shan T, Li L, Simmonds P, Wang C, Moeser A, Delwart E: The fecal virome of pigs on a high-density farm. J Virol, 85 (22): 11697-11708, 2011. DOI: 10.1128/JVI.05217-11
  3. Luo Z, Roi S, Dastor M, Gallice E, Laurin MA, L’Homme Y: Multiple novel and prevalent astroviruses in pigs. Vet Microbiol, 149, 316-323, 2011. DOI: 10.1016/j.vetmic.2010.11.026 Cai Y, Yin W, Zhou Y, Li B, Ai L, Pan M, Guo W: Molecular detection of Porcine astrovirus in Sichuan Province, China. Virol J, 13:6, 2016. DOI: 10.1186/S12985-015-0462-6
  4. Shan T, Li L, Simmonds P, Wang C, Moeser A, Delwart E: The fecal virome of pigs on a high-density farm. J Virol, 85 (22): 11697-11708, 2011. DOI: 10.1128/JVI.05217-11
  5. Xiao CT, Luo Z, Lv SL, Opriessnig T, Li RC, Yu XL: Identification and characterization of multiple porcine astrovirus genotypes in Hunan province, China. Arch Virol, 162 (4): 943-952, 2016. DOI: 10.1007/s00705- 016-3185-0
  6. Song D, Huang D, Peng Q, Huang T, Chen Y, Zhang T, Nie X, He H, Wang P, Liu Q, Tang Y: Molecular characterization and phylogenetic analysis of porcine epidemic diarrhea viruses associated with outbreaks of severe diarrhea in piglets in Jiangxi, China 2013. PLoS One, 10 (3):e0120310, 2015. DOI: 10.1371/journal.pone.0120310 Zhang F, Ye Y, Song D, Guo N, Peng Q, Li A, Zhou X, Chen Y, Zhang M, Huang D, Tang Y: A simple and rapid identification method for newly emerged porcine Deltacoronavirus with loop-mediated isothermal amplification. Biol Res, 50:30, 2015. DOI: 10.1186/s40659-017-0135-6
  7. Li JS, Li MZ, Zheng LS, Liu N, Li DD, Duan ZJ: Identification and genetic characterization of two porcine astroviruses from domestic piglets in China. Arch Virol, 160 (12): 3079-3084, 2015. DOI: 10.1007/ s00705-015-2569-x Cai Y, Yin W, Zhou Y, Li B, Ai L, Pan M, Guo W: Molecular detection of Porcine astrovirus in Sichuan Province, China. Virol J, 13:6, 2016. DOI: 10.1186/s12985-015-0462-6
  8. Machnowska P, Ellerbroek L, Johne R: Detection and characterization of potentially zoonotic viruses in faeces of pigs at slaughter in Germany. Vet