Journals / Alınteri Zirai Bilimler Dergisi / 2018 / Cilt: 33 - Sayı: 1

PCR-RFLP Metodu Kullanılarak Manda Leptin Geni Polimorfizminin Anadolu Mandalarında Karakterizasyonu

Characterization of Bubaline Leptin Gene Polymorphism in Anatolian Buffaloes By Using PCR-RFLP Method

Pages
93–97
DOI
—
🏛️Bibliographic metadata and full text access for this article are provided via DergiPark.
DergiPark Record ↗
✨

AI Summary & Key Takeaways

AI Insight
⚡ TL;DR(Too Long; Didn't Read)

Bu çalışma, Anadolu mandalarında PCR-RFLP yöntemi ile manda leptin geni T1131G polimorfizminin tanımlanmasına ilişkin ilk çalışma sonuçlarıdır.

📌 3 Key Takeaways

🎯
Objective & Hypothesis:Leptin yağ dokusunda ağırlıklı olarak ifade edilen 16 kDa protein üreten bir hormondur.
📊
Key Findings & Data:Leptin geni, süt verimi, karkas ve et kalitesi, büyüme, yem tüketimi ve üreme gibi çeşitli fonksiyonel özellikler üzerine pleotropik etkilere sahiptir.
💡
Conclusion & Impact:Bu çalışma, Anadolu mandalarında PCR-RFLP yöntemi ile manda leptin geni T1131G polimorfizminin tanımlanmasına ilişkin ilk çalışma sonuçlarıdır.
🔬Design:Research Article
📍Scope:Comprehensive Sample
⚙️Variables:Domain Parameters

Abstract

Leptin yağ dokusunda ağırlıklı olarak ifade edilen 16 kDa protein üreten bir hormondur. Leptin geni, süt verimi, karkas ve et kalitesi, büyüme, yem tüketimi ve üreme gibi çeşitli fonksiyonel özellikler üzerine pleotropik etkilere sahiptir. Bu nedenle, bu araştırma Anadolu mandalarındaki manda leptin geninde tek nükleotid polimorfizmini belirlemek amacıyla yapılmıştır. Çalışmada, Leptin geninde 513 baz çiftlik bir bölge çoğaltılmıştır. 513 baz çiftlik fragment içerisinde T1131G polimorfizmini belirlemek üzere PCR-RFLP yöntemi kullanılmıştır. Anadolu mandalarında manda leptin geni T1131G polimorfizminin belirlenmesi için DdeI restriksiyon enzimi kullanılmıştır. Yapılan PCR-RFLP analizi sonucunda ele alınan Anadolu mandalarında TT, GT ve GG genotipleri belirlenmiş ve T ve G allel frekansları sırasıyla 0.478 ve 0.521 olarak bulunmuştur. Bu çalışma, Anadolu mandalarında PCR-RFLP yöntemi ile manda leptin geni T1131G polimorfizminin tanımlanmasına ilişkin ilk çalışma sonuçlarıdır.

Özet

Leptin is a hormone which produces 16 kDa protein predominantly expressed in adipose tissue. Leptin gene has pleiotropic effects on several functional traits such as milk yield, carcass and meat quality, growth, feed intake and fertility. Therefore, this study was performed to identify single nucleotide polymorphism of bubaline leptin gene in Anatolian buffaloes. In this study, 513 bp of leptin DNA fragment was amplified. A PCR-RFLP analysis was used to identify bubaline leptin gene T1131G polymorphism. DdeI restriction enzyme was used to genotype bubaline leptin gene T1131G polymorphism in Anatolian buffaloes. The analysis revealed TT, GT and GG genotypes in Anatolian buffaloes. Allele frequencies of T and G were found 0.478 and 0.521, respectively. This study is the first report of identification of bubaline leptin gene T1131G polymorphism by using PCR-RFLP method in Anatolian buffaloes.

🔖

Cite This Article

KAPLAN, S. (2018). PCR-RFLP Metodu Kullanılarak Manda Leptin Geni Polimorfizminin Anadolu Mandalarında Karakterizasyonu. Alınteri Zirai Bilimler Dergisi, Cilt: 33 - Sayı: 1, 93–97. https://ajindex.com/articles/144547

📄 Full Text PDF Viewer

📄

PDF görüntüleyici hazırlanıyor...

References (8)

  1. Adikari, M., 2006. Molecular characterization of leptin gene in murrah buffaloes. NDRI, Karnal. Albarella, S., Ciotola, F., D’Anza, E., Coletta, A., Zicarelli, L., Peretti, V., 2017. Congenital Malformations in River Buffalo (Bubalus bubalis). Animals 7: 9. Biolabs, N.E., Nebcutter V2. 0. Found at http://tools. neb. com/NEBcutter2/index. php. Bondoc, O.L., 2013. Genetic Diversity and Relationship of Domestic Buffalo and Cattle Breeds and Crossbreeds (Subfamily Bovinae) in the Philippines Based on the Cytochrome C Oxidase I (COI) Gene Sequence. The Philippine Agricultural Scientist 96. Borghese, A., Mazzi, M., 2005. Buffalo population and strategies in the world. Buffalo production and research 67: 1-39.
  2. Buchanan, F., Van Kessel, A., Waldner, C., Christensen, D., Laarveld, B., Schmutz, S., 2003. Hot topic: an association between a leptin single nucleotide polymorphism and milk and protein yield. Journal of Dairy Science 86: 3164- 3166. Cho, S., Park, T.-S., Yoon, D.-H., Cheong, H.-S., Namgoong, S., Park, B.-L., Lee, H.-W., Han, C.-S., Kim, E.-M., Cheong, I.-C., 2008. Identification of genetic polymorphisms in FABP3 and FABP4 and putative association with back fat thickness in Korean native cattle. BMB reports 41: 29-34.
  3. Clempson, A., Pollott, G., Brickell, J., Bourne, N., Munce, N., Wathes, D., 2011. Evidence that leptin genotype is associated with fertility, growth, and milk production in Holstein cows. Journal of dairy science 94: 3618-3628.
  4. Cockrill, W.R., 1981. The water buffalo: a review. British Veterinary Journal 137: 8-16.
  5. Datta, S., Adikari, A., Chauhan, A., Verma, A., Gupta, I., Chauhan, I., Azad, M.S., HM, Y., 2012. Nucleotide sequence variation in leptin gene of Murrah buffalo (Bubalus bubalis). Exper Anim Med Res 2: 130-136.
  6. De la Rosa Reyna, X., Montoya, H., Castrellón, V., Rincón, A., Bracamonte, M., Vera, W., 2010. Polymorphisms in the IGF1 gene and their effect on growth traits in Mexican beef cattle. Genet Mol Res 9: 875-883.
  7. Dekkers, J.C., 2002. Multifactorial genetics: The use of molecular genetics in the improvement of agricultural populations. Nature Reviews Genetics 3: 22. Frühbeck, G., 2001. A heliocentric view of leptin. Proceedings of the Nutrition Society 60: 301-318.
  8. Grisart, B., Coppieters, W., Farnir, F., Karim, L., Ford, C., Berzi, P., Cambisano, N., Mni, M., Reid, S., Simon, P., 2002. Positional candidate cloning of a QTL in dairy cattle: identification of a missense mutation in the bovine DGAT1 gene with major effect on milk