Dergiler / Osmangazi Tıp Dergisi / 2022 / Cilt: 44 - Sayı: 6
Akut Gastroenteritli Hastaların Klinik Örneklerinde Salmonella, Shigella ve Campylobacter Türlerinin Kültür Yöntemi ve Moleküler Yöntem ile Tespit Edilmesi
- Sayfa
- 807–813
- DOI
- —
Özet
Akut gastroenterit (AGE), tüm dünyada yaygın olarak görülen enfeksiyon hastalıkları arasındadır. Campylobacter, Salmonella, Shigella türleri AGE’nin bakteriyel etkenleri arasında ilk sıralarda bulunmaktadır. Bu çalışmada, laboratuvarımıza gönderilen gaita örneklerinde kültür yöntemi ve moleküler yöntemle Campylobacter, Salmonella ve Shigella sıklığını saptamak ve her iki yöntemin kıyaslanması amaçlanmıştır. 2019-2020 yılları arasında Namık Kemal Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi’ne ishal yakınması ile başvuran, ayaktan erişkin ve çocuk hasta örnekleri dahil edilmiştir. Dışkı örnekleri Campylobacter, Salmonella ve Shigella türlerinin tespiti için konvansiyonel kültür yöntemleri ve polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) yöntemi ile çalışılmıştır. Çalışmamızda 400 (%77 yetişkin, %23 çocuk) hastaya ait dışkı örneği değerlendirilmiştir. Örneklerin kültür ile değerlendirilmesinde 14 örnekte (%3.5) etken saptanmış; 10’u (%2.5) Campylobacter spp., 4’ü (%1) Salmonella spp. olarak tiplendirilmiş, Shigella spp. izole edilememiştir. Kültür yöntemi ile Campylobacter spp. ve Salmonella spp. sıklığı çocuklarda sırasıyla %6.5 ve %2.2, yetişkinlerde %1.3 ve %0.7 olarak saptanmıştır. Örneklerin PZR ile değerlendirilmesinde 38 örnekte (%9.6) etken saptanmış; 33’ünde (%8.3) Campylobacter spp., 5’inde (%1.3) Salmonella spp. varlığı tespit edilmiş, hiçbir örnekte Shigella spp. saptanamamıştır. Kültürde üreme saptanan 14 dışkı örneğinin tamamında PZR yönteminde de aynı etken mikroorganizma tespit edilmiştir. 24 örnekte ise kültürde üreme saptanmayıp sadece PZR’de Campylobacter spp. veya Salmonella spp. saptanmıştır. Gaita kültürü AGE tanısında altın standart yöntem olmasına rağmen araştırmamız sonucunda PZR’nin hem hızlı sonuç vermesi hem de saptama oranının yüksek olması nedeniyle kültüre avantajlı olduğu görülmüştür. Bu nedenle moleküler yöntemlerin rutin tanıda kullanılmasının faydalı olacağı kanaatindeyiz.
Abstract
Acute gastroenteritis (AGE) is among the most common infectious diseases all over the world. Campylobacter, Salmonella and Shigella species are among the first bacterial agents of AGE. In this study, it was aimed to determine the prevelance of Campylobacter, Salmonella and Shigella by culture method and molecular method in stool samples sent to our laboratory and to compare both methods. Samples of adult and pediatric patients who applied to the Namık Kemal University Medical Faculty Hospital with the complaint of diarrhea between 2019-2020 were included. Stool samples were studied by conventional culture methods and polymerase chain reaction (PCR) method for the detection of Campylobacter, Salmonella and Shigella species. In our study, stool samples of 400 (77% adults, 23% children) patients were evaluated. In the evaluation of the samples by culture, agents were detected in 14 samples (3.5%), 10 (2.5%) were Campylobacter spp., 4 (1%) were Salmonella spp, Shigella spp. could not be isolated. By culture method, Campylobacter spp. and Salmonella spp. prevalence was 6.5% and 2.2% in children, and 1.3% and 0.7% in adults, respectively. In the evaluation of the samples by PCR, the causative agent was found in 38 samples (9.6%); Campylobacter spp. was found in 33 (8.3%) and Salmonella spp. was found in 5 (1.3%) samples, Shigella spp. not detected. The same causative microorganism was detected in the PCR method in all 14 stool samples with growth in the culture. In 24 samples, no growth was detected in the culture, only by PCR method, Campylobacter spp. or Salmonella spp. detected. Although stool culture is the gold standard method in the diagnosis of AGE, as a result of our research, PCR was found to be advantageous to culture because of its rapid results and high detection rate. Therefore, we believe that it would be beneficial to use molecular methods in routine diagnosis.