Irak-Erbil'den Alınan Bazı Toprak Numunelerinden Streptomyces Bakterilerinin İzolasyonu, Ekstraselüler Hidrolitik Enzim Kabiliyetlerinin Belirlenmesi ve 16S rDNA Analizi

Özet

Bu çalışmada Irak’ın Erbil ilinde belli noktalardan alınan toprak numunelerinden Streptomyces cinsi bakterileri izole edilerek bazı ekstraselüler enzimlerin aktiviteleri belirlenmiş ve 16S rDNA gen bölgesinin filogenetik analizi yapılmıştır.Seyreltme plak yöntemi ile 26 farklı Streptomyces cinsi bakteri izole edilmiş ve daha sonra saflaştırma işlemi yapılmıştır. İzole edilen 26 Streptomyces suşuna yapılan ekstraselüler hidrolitik enzim aktivitesi çalışmalarında 3 izolat ksilinaz aktivitesinde, 19 izolat amilaz aktivitesinde ve 15 izolat proteaz aktivitesinde pozitif sonuç gösterirken hiçbir izolat lipaz aktivitesi göstermemiştir. Genomik DNA’sı izole edilen 7 izolatın 16S rDNA gen bölgesi 27F ve 1492R evrensel primerleri ile amplifiye edilip sekans analizi yapılmıştır. Bu sonuçlar Mega7.0.18 paket programı ile Maximum Likelihood algoritması kullanılarak filogenetik uzaklık matrisi olan (Jukes ve Cantor 1969) metodu ile filogenetik ağaç oluşturulmuştur. Oluşan filogenetik ağaçta NCBI’dan dizileri alınan Streptomyces suşları ile çalışmamızda kullanılan suşlar güçlü bir homoloji ile kümelenerek filogenetik analizleri yapılmıştır.