Dergiler / Viral Hepatitis Journal / 2021 / Cilt: 27 - Sayı: 3
Pakistanlı Hastalarda Viral Dirençle İlişkili Mutasyonlar İçin Hepatit B Virüsü Ters Transkriptaz Domaininin Moleküler Analizi
- Sayfa
- 153–158
- DOI
- —
Özet
Amaç: Mevcut çalışma, yanıtsız Pakistanlı hastalardan hepatit B virüsü (HBV) genomunun ters transkriptaz (RT) domainindeki dirençli mutasyonları taramak için tasarlanmıştır. Gereç ve Yöntemler: Çalışmaya farklı nükleot(z)id analogları alan toplam 22 hasta dahil edildi. On sekiz ay sonra, 18 hasta yanıt verdi ve 4 hasta yanıt vermedi. Yanıt vermeyen hastaların örneklerinden alınan virüsün RT domaini amplifiye edildi ve dizilendi. Diziler hizalandı ve RT domaini mutasyonları açısından analiz edildi. Bulgular: Yanıt veren hastaların ortalama alanin aminotransferaz (ALT) ve viral yükü, yanıt vermeyen hastalarla karşılaştırıldığında önemli ölçüde azaldı. Yanıt vermeyen hastalardan alınan 4 örnekten 2’si başarıyla sıralandı. Birinci hastanın örneğinden rtY135S, rtI169P, rtV173P, rtL180I, rtA181V, rtT184Y ve rtM204V mutasyonları belirlenirken ikinci hastanın örneğinden rtL80V/rtL80G ve rtY135S mutasyonları belirlendi. Sonuç: Pakistanlı hastalarda saptanan HBV genomunda rtY135S, rtI169P, rtV173P, rtL180I, rtA181V, rtT184Y, rtM204V, rtL80V/rtL80G ve rtY135S mutasyonları mevcuttu. Bu mutasyonlar, virüse lamivudin, telbivudin ve adefovire karşı tam, entecavire karşı kısmen direnç sağlamaktaydı. Bununla birlikte, tenofovire karşı viral dirençle ilişkili hiçbir mutasyon bulunmadı.
Abstract
Objectives: Current study was designed to screen out the resistant mutations in reverse transcriptase (RT) domain of hepatitis B virus (HBV) genome from non-responder Pakistani patients. Materials and Methods: A total of 22 patients, receiving different nucleot(s)ide analogues were included in the study. RT domain of the virus from samples of non-responder patients was amplified and sequenced. Sequences were aligned and analyzed for RT domain mutations. Results: After 18 months, 18 patients were responder and 4 were non-responder. Mean alanine aminotransferase (ALT) and viral load of responder patients decreased significantly as compared to those of non-responder patients. Two of the 4 samples from non-responders were successfully sequenced. Mutations rtY135S, rtI169P, rtV173P, rtL180I, rtA181V, rtT184Y and rtM204V were identified from the sample of patient 1, while rtL80V/rtL80G and rtY135S were identified from the sample of patient 2. Conclusion: Mutations rtY135S, rtI169P, rtV173P, rtL180I, rtA181V, rtT184Y, rtM204V, rtL80V/rtL80G, and rtY135S are present in genome of HBV circulating in Pakistani patients. These mutations give resistance to virus against lamivudine, telbivudine, adefovir, and partially resistance against entecavir. However, no mutation was found to be associated with the viral resistance against tenofovir.