Distribution of Gram Negative Bacteria and Evaluation of Resistance Profiles

Havva TÜNAY, Fadime ARSLAN, Serap PAMUKÇUOĞLU, Hanife TAŞ UZEL, Mehmet Hamdi PAMUKÇUOĞLU

Özet

Amaç: Bu çalışmada Afyonkarahisar Devlet Hastanesi poliklinik hastalarının idrar kültürlerinde üreyen Gram negatif etkenlerin dağılımı ve antibiyotik direnç durumunun incelenmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmamızda 2012-2013 yılları arasında hastanemiz mikrobiyoloji laboratuvarına gönderilen poliklinik hastalarının idrar örnekleri retrospektif olarak incelenmiştir. Üreyen bakteriler konvansiyonel ve/veya otomatik Vitec 2.0 sistemi ile çalışılmıştır. Antibiyotik duyarlılıkları Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemiyle veya Vitec sistemiyle değerlendirilmiş; Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) kriterlerine göre yorumlanmıştır. Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) varlığı çift disk sinerji testi (ÇDST) veya otomatik sistem ile araştırılmıştır. Bulgular: Çalışmaya poliklinik hastalarından 671 izolat dahil edilmiştir. İzole edilen suşların 427'sinin (% 63.6) Escherichia coli, 165'inin (% 24.6) Klebsiella spp., 22'sinin (% 3.3) Pseudomonas spp., dokuzunun (% 1.3) Acinetobacter spp., 41'inin (%6.1) Proteus spp., yedisinin (% 1.0) Serratia spp. olduğu saptanmıştır. E.coli izolatlarının 97'sinde (% 22.8), Klebsiella spp. izolatlarının 41'inde (% 24.8) GSBL pozitifliği izlenmiştir. En sık izole edilen tür olan E.coli için, suşların % 31.1'i trimetoprim-sülfametoksazole, % 16'sı siprofloksasine, % 3.6'sı nitrofrontoine dirençli olarak saptanmıştır. Enterobactericeae suşlarında karbapenem grubu antibiyotiklere direnç saptanmazken, aminoglikozid grubu antibiyotiklere duyarlılık oranı yüksek bulunmuştur. Tartışma: Üriner sistem infeksiyonlarının sağaltımında; her geçen gün artan antimikrobiyal direnç oranlarına sahip mikroorganizmaları göz önünde bulundurmak, GSBL üretimini ve direnç gelişimini önlemek için; hastanede yatan hastalarda olduğu gibi ayaktan hastalara da doğru endikasyonda antibiyotik kullanılmasına büyük bir titizlik gösterilmesi, uygunsuz ve gereksiz antibiyotik kullanımından kaçınılması gerekmektedir.

Abstract

Aim: In this study, we aimed to examine the distributon of Gram negative bacteria isolated from urine cultures of out-patients in Afyonkarahisar State Hospital and evaluate the antimicrobial resistance rates of these pathogens. Material and Method: Urine samples of out-patients which were sent to microbiology laboratory between 2012-2013 were retrospectively evaluated. The isolates were identified using conventional methods and/or automated Vitec 2.0 system. Antibiogram sensitivities were determined by Kirby-Bauer disc diffusion method or automated system and interpreted on the basis of Clinical and Laboratory Standards Institute (CSI) criteria. Double disc sinergy test (DDST) or Vitec 2.0 system was used to detect extended spectrum betalactamase (ESBL).When conventional methods could't be clarified according to their colony morphologies, gram staining patterns, biochemical test; automated system has been used. Results: A total of 671 isolates acquired from urine samples were studied. 427 Escherichia coli (63.6 %), 165 Klebsiella spp. (24.6 %), 22 Pseudomonas spp. (3.3 %), nine Acinetobacter spp. (1.3 %), 41 Proteus spp. (6.1 %) and seven Serratia (1.0 %) strains were identified among isolates. 97 E.coli (22.8 %) and 41 Klebsiella (24.8 %) isolates were ESBL positive. Most common bacteria were E.coli, 31.1 % of which were resistant to trimethoprim-sulfamethoxazole, 16 % to ciprofloxacin and 3.6 % to nitrofurantoin. Among Enterobacteriaceae, no resistance aganist carbapenems were detected. Moreover, aminoglicoside sensitivity rate was significantly high in this group. Discussion: Microorganisms that have progressively increasing antimicrobial resistance should be considered in the treatment of urinary tract infections. It is also important to use the most appropriate antibiotics to avoid unnecessary usage of these drugs in order to decrease drug resistance rates and ESBL production which may effect the success of the treatment.