Dergiler / Flora İnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi / 2021 / Cilt: 26 - Sayı: 4
Türkiye’de Atık Suda SARS-CoV-2 RNA’nın Basit bir Konsantrasyon Yöntemiyle TespitEdilmesi: Çorum’da Pilot Çalışma
- Sayfa
- 620–627
- DOI
- —
Özet
Giriş: Toplumda dolaşan mikrobiyolojik patojenlerin izlenmesinde atık suyu izlemenin avantajları birçok çalışmayla gösterilmiştir. Bizdeçalışmamızda basit bir konsantrasyon metoduyla atık suda SARS-CoV-2 RNA tespit etmeyi amaçladık. Materyal ve Metod: Çalışmamızda Ekim-Kasım 2020 tarihleri arasında Çorum Kentsel Atık Su Arıtma Tesisi’nden toplanan 7 atık sunumunesi incelendi. Sorbent torbalar 24 saat suda bırakıldı. Torbalar virüsü yakalamak ve konsantre etmek için kullanıldı. SARS CoV-2RNA, ters transkripsiyon-kantitatif polimeraz zincir reaksiyonu (RT-qPCR) testleri kullanılarak saptandı. Bulgular: Sonuç olarak, alınan 7 numuneden 3’ü N ve ORF1ab hedef gen bölgeleri için pozitifti. Sonuç: Çalışmamız, farklı konsantrasyon ve yakalama yöntemi ile atık sularda SARS-CoV-2 RNA tespitini bildiren ilk çalışmadır.
Abstract
Introduction: Many studies have shown the advantages of monitoring wastewater in the evaluation of microbiological pathogens cir culating in the community. It was aimed to detect of SARS-CoV-2 RNA with a simple concentration method in wastewater in this study. Materials and Methods: In our study, 7 wastewater samples were investigated, which were collected from the Urban WastewaterTreatment Plant (WWTP) of Çorum, between October to November 2020. Sorbent bags were left in water for 24 hours. Then theywere used to trap and concentrate the virus. Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) RNA detected by usingreverse transcription-quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) assays.Results: As a result, 3 of the 7 samples taken were positive for N and ORF1ab target gene regions.Conclusion: This is the first study reporting the detection of SARS-CoV-2 RNA in wastewater with different concentration and capturemethod.