Brucella melitensis dış membran protein geni Omp31’in klonlanması

Özet

Bruselloz hayvanlardan veya hayvansal ürünlerden insanlara bulaşan en önemli zoonotik hastalıklardan birisidir. Brucella melitensis, brusella cinsi içerisinde en patojen türlerden birisidir. B. melitensis'in dış membran proteini 31 (Omp31) koruyucu bir immünojen ve önemli bir aday aşı olarak kabul edilmektedir. Bu çalışmada, B. melitensis Rev 1 suşundan Omp31’i kodlayan genin (omp31) klonlanması amaçlandı. Çalışmada materyal olarak B. melitensis REV-1 canlı aşı suşu kullanıldı. Suşun canlandırılmasının ardından, DNA ekstraksiyonu yapıldı. Dış membran proteini kodlayan gen bölgesi, gen bankasından bulundu. Bu bölgeyi klonlamak için gerekli primerler manuel olarak dizayn edildi. Primer dizaynından sonra polimeraz zincir reaksiyonu yoluyla çoğaltılan gen bölgesi, pET28a ekspresyon vektörüne klonlanarak Escherichia coli BL21 bakterisine transformasyonu gerçekleştirildi. E. coli BL21’den plazmid ekstraksiyonu yapıldı. Klonlama için kullanılan restriksiyon enzimi ile kesim sonucunda insert ve plazmid ayrı olarak gözlemlendi. Beklenen büyüklükte (790 bp) bulunan insert, tekrar klonlama primeri ile çoğaltılarak doğrulamak amacıyla sekans analizi yapıldı. Sekans analizi sonrasında elde edilen dizi gen bankası ile karşılaştırıldı ve insertin B. melitensis dış membran proteini olduğu doğrulandı. Bundan sonraki yapılacak çalışmalarla da klonlanan rekombinant dış membran proteini Omp31 (rOmp31)’in antijenik özelliğinin araştırılarak aşı adayı olma potansiyelinin belirlenmesi gerekmektedir.

Abstract

Brucellosis is one of the most important zoonotic diseases transmitted to humans from animals or animal products. Brucella melitensis is the most pathogenic species in the genus brucella. The outer membrane protein 31 (Omp31) of B. melitensis is considered to be a protective immunogen and an important candidate vaccine. In this study, cloning from B. melitensis Rev 1 strain of Omp31 coding gene (omp31) was aimed. Brucella melitensis REV-1 live vaccine strain was used in the study. After reactivation of strain, DNA was extracted from bacterial culture. Gene sequence which encodes outer membrane protein was obtained from Gene Bank. Primers were designed to clone this region. After primer design, the gene region amplified by the polymerase chain reaction was cloned into the pET28a expression vector and transformed into Escherichia coli BL21 bacteria. Plasmid extraction was performed from E. coli BL21. The insert and plasmid were separately observed as a result of cutting with the restriction enzyme used for cloning. Expected size (790 bp) insert amplified with cloning primers again and amplicon was sequenced. The sequence obtained after sequencing analysis was compared to the gene bank and confirmed to be the outer membrane protein of B. melitensis. Further studies are required to investigate the antigenic properties of the cloned recombinant outer membrane protein Omp31 (rOmp31) and determine the potential to be a candidate for vaccination.