Determination of the Tumor Virus B Locus in Turkish Native Chicken Breeds

Özet

Avian leukosis virusleri (ALV), tavuklarda tümör oluşturan retrovirüslerdir. Tipik olarak, ALV hayvan yetiştirme yöntemleri ile kontrol edilir. Bununla birlikte, genetik gelişme ve/veya selektif ıslah teknikleri, hastalığa direnç için benzersiz olanaklar sunmaktadır. Tümör viral B (TVB) lokusu ALV üç alt grubunun (B, D ve E) viral girişine ortam sağlayan/engelleyen veya aracı olan gruplara özgü yüzey reseptörlerini kodlar. Bu lokusun 172. ve 184. bazlarındaki iki adet tek nükleotit polimorfizmleri TVB*S1, TVB*S3 ve TVB*R allellerini ayırt edilmesine imkan sağlar. TVB*R'nin kodladığı reseptör ALVB, ALVD veya ALVE alt gruplarının hücreye viral girişini engeller. PCR-RFLP yöntemi kullanılarak Türkiye yerli tavuk ırkları olan Denizli ve Gerze tavuklarındaki TVB genotipleri belirlenmiştir. Hem Gerze hem de Denizli ırkında, TVB*S1 alleli yaygın ve TVB*S3 alleli nadir olarak görülmüştür. TVB*R alleli, Gerze popülasyonunda seyrek olarak görülürken Denizli horozu popülasyonlarında tespit edilememiştir. TVB*S1, TVB*S3 ve TVB*R'nin allel frekansları sırasıyla Gerze tavuklarında 0.96, 0.02 ve 0.02, Denizli horozlarında sırasıyla 0.98, 0.02 ve 0.00 olarak hesaplanmıştır

Abstract

Avian leukosis viruses (ALV) are retroviruses that can induce tumors in chicken. Typically, ALV is controlled through husbandry. However, genetic improvement and/or, selective breeding techniques, offer the unique possibility of true resistance. The tumor virus B (TVB) locus transcribes the cellular receptor that mediates an infection through B, D, and E subgroups of avian leukosis virus. Two single nucleotide polymorphisms (SNPs) at nucleotide positions 172 and 184 of the TVB locus account for the three major alleles, TVB*S1, TVB*S3, and TVB*R. The receptor encoded by TVB*R allele prevents viral entry into the cell of ALVB, ALVD, or ALVE subgroups. In this study, both SNPs at the TVB locus of Turkish native chicken breeds were investigated using a PCR-RFLP technique to detect. In both Gerze and Denizli breeds, the TVB*S1 allele was common and TVB*S3 was rare, respectively. The TVB*R allele was rare in the Gerze population and absent in the Denizli population. Allele frequencies of TVB*S1, TVB*S3, and TVB*R were evaluated as 0.96, 0.02, and 0.02 in Gerze chickens and 0.98, 0.02, and 0.00, in Denizli chickens, respectively