Dergiler / Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi / 2013 / Cilt: 19 - Sayı: 3
Phenotypic, genotypic characterisation and antimicrobial susceptibility determination of lactococcus garvieae strains
- Sayfa
- 375–381
- DOI
- —
Özet
Araştırmada, gökkuşağı alabalığı işletmelerinden izole edilmiş olan 10 adet Lactococcus garvieae suşunun 3 adet referans suşla (İspanya, İngiltere ve ATCC 43921) karşılaştırmalı olarak fenotipik ve genotipik özellikleri incelenmiştir. L. garvieae suşlarının fenotipik özelliklerinin belirlenmesinde konvansiyonel mikrobiyolojik ve Rapid 32 STREP testleri kullanılmıştır. Rapid 32 STREP sistemde suşlar arasında β-Glucuronidase, D-ribose, sorbitol, lactose, raffinose, alanyl-phenylalanyl-proline arylamidase, pyrrolidonyl arylamidase, hippurate hydrolysis, urease testleri yönüyle farklıklar olmasına rağmen API Webde tüm suşlar L. garvieae olarak doğrulanmıştır. ERIC2 primerinin kullanıldığı RAPD PCR analizinde L. garveae izolatları %70 benzerlik katsayısına göre 3 farklı genotipe ayrılmış ve Türkiye kökenli izolatların büyük bir bölümü (8 izolat) predominant tip olan LG1 genotipine dahil olduğu belirlenmiştir. Ayrıca bu çalışmada L. garvieae suşlarının antibiyotik duyarlılık testlerinde ülkemizde balıklarda sıklıkla kullanılan gentamisin, neomycin, lincomycin, sulphamethoxazoletrimetoprim, oksitetrasiklin, eritromycin, amoxycillin, florfenikol ve doksisikline karşı direnç geliştirmiş oldukları belirlenmiştir.
Abstract
In this study, phenotypic and genotypic features of 10 L. garvieae strains isolated from rainbow trout farms were examined with 3 reference strains (Spain, England and ATCC 43921) comperativly. Rapid 32 STREP and conventional microbiologic tests were used for determining phenotipic features of L. garvieae strains. Altough there are diff erences, in Rapid 32 STREP system, between strains in terms of β-Glucuronidase, D-ribose, sorbitol, lactose, raffinose, alanyl-phenylalanyl-proline arylamidase, pyrrolidonyl arylamidase, hippurate hydrolysis, urease tests, all strains have been confirmed as L. garvieae by API web. In RAPD PCR analysis, in which ERIC 2 primer is used, L. garvieae isolates were genotyped within 3 separate clusters according to similarity coefficient index of 70%, and it was detected that a vast majority of isolates with Turkey-origin (8 isolates) belongs to predominant type LG1 genotype. In addition to this, antimicrobial tests of L. garvieae strains shows that there are resistance against gentamycin, neomycin, lincomycin, sulfamethoxazole-trimethoprim, oxytetracycline, erythromycin, amoxicillin, florfenicol and doxycycline, which are frequently used on fish in our country.