Identification of Genetic Variation of Melatonin Receptor 1A (MTNR1A) Gene in Kıvırcık Breed Ewes by MnlI and RsaI Restriction Enzymes

Kıvırcık Irkı Koyunlarda Melatonin Reseptör 1A (MTNR1A) Geninin MnlI ve RsaI Restriksiyon Enzimleri ile Genetik Varyasyonunun Belirlenmesi

Özet

Melatonin reseptör 1A (MTNR1A) geni koyunlarda mevsime bağlı üreme fonksiyonlarını düzenleyen bir hormon olan melatonini kodlamaktadır. Bu çalışmanın amacı Kıvırcık ırkı koyunda MTNR1A geninin genetik varyasyonunun ve allel çeşitliliğini belirlemektir. Kırklareli ve İstanbul illerindeki 5 farklı çiftlikten olmak üzere toplam 110 adet Kıvırcık ırkı koyununa ait kan örnekleri toplanarak DNA izolasyonu yapılmıştır. MTNR1A geninde polimorfik olan ekzon 2 bölgesi PZR ile yükseltgenmiş olup MnlI ve RsaI enzimleri kullanılarak allel ve genotip tespitleri yapılmıştır. Gözlenen alleller ve genotipler MnlI için M (0.891) ve m (0.109) alleleri ile MM (0.782) ve Mm (0.218) genotipleri, RsaI için C (0.682) ve T (0.318) alleleri ile CC (0.582), CT (0.200) ve TT (0.218) genotipleri olmuştur. Kıvırcık koyunlarında mm genotipi gözlenmemiş olup, en yüksek oranda gözlenen genotipler, koyunlarda mevsim dışı üreme faaliyetlerini pozitif olarak etkilediği bilinen MM (%78) ve CC (%58) olarak tespit edilmiştir. Büyük bir çoğunluğu MM ve CC genotiplerine sahip olan Kıvırcık ırkı koyunların mevsim dışı kuzulatmada yaygın olarak kullanılması yetiştiricilere önerilebilir.

Abstract

Melatonin receptor 1A (MTNR1A) gene encodes melatonin hormone which regulates the function of seasonal reproductive activity in sheep. The aim of this study was to make the genetic characterization and identify the variant alleles of MTNR1A gene in Kıvırcık breed. Blood samples of 110 Kıvırcık sheep were collected from five different farms located in Kırklareli and Istanbul. DNA extraction was performed from blood samples. Exon 2, the polymorphic region of Melatonin receptor 1A gene, was amplified and PCR products were genotyped by using MnlI and RsaI enzymes. The observed alleles and genotypes for MnlI enzyme were; M (0.891), m (0.109) and MM (0.782), Mm (0.218) respectively. Kıvırcık sheep was null from mm genotype. Also identified alleles were C (0.682), T (0.318) and genotypes were CC (0.582), CT (0.200), TT (0.218) for RsaI enzyme. The most frequent genotypes were MM (78%) and CC (58%) in Kıvırcık ewes. Since MM and CC genotypes were known with their positive effect on out of season reproductive activities, Kıvırcık ewes with these genotypes might suggested to be used in out of season lambing when demanded.