Dergiler / Kafkas Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi / 2018 / Cilt: 24 - Sayı: 3
Genetic Characterization of Porcine Parvovirus 7 (PPV7) Isolates in Fujian, China
- Sayfa
- 473–477
- DOI
- —
Özet
In this study, we sequenced and analyzed the complete genomes of the porcine parvovirus 7 (PPV7) isolated in Fujian, Southeast China. Genomic comparison revealed that PPV7 isolates in Fujian shared higher (more than 98.5%) nucleotide homology and closer relationship with other PPV7 strains. Phylogenetic analysis based on NS indicated that PPV7 formed a distinct cluster (proposed Chapparvovirus) closer to subfamily Parvovirinae. However, phylogenetic analysis based on genome and VP showed that PPV7 isolates formed a distinct cluster closer to subfamily Densovirinae. No recombination event observed suggesting recombination did not contribution to the genetic diversity of PPV7. These findings demonstrated that PPV7 continuous circulating in China, which may help us to understand the evolution diversity of porcine parvoviruses.
Abstract
Bu çalışmada, Güneydoğu Çin’in Fujian Eyaletinde elde edilen domuz parvovirus 7 (PPV7) izolatlarının tüm genomu sekanslandı ve analiz edildi. Genomik karşılaştırmada Fujian’dan elde edilen PPV7 izolatlarının diğer PPV7 suşları ile yüksek nükleotid benzerlik (%98.5’den daha fazla) göstererek yakın ilişkili olduğu gözlemlendi. NS temelli filogenetik analiz PPV7’nin Parvovirinae alt familyasına yakın farklı topluluk oluşturduğunu (Chapparvovirus olabileceği önerilen) gösterdi. Ancak, genom ve VP temelli filogenetik analiz PPV7 izolatlarının Densovirinae alt familyasına daha yakın topluluk oluşturduğunu gösterdi. Rekombinasyonun gözlemlenmemesi nedeniyle PPV7’nin genetik farlılıklarının oluşmasında rekombinasyonun katkısının olmadığı belirlendi. Bu bulgular, Çin’de PPV7’nin halen mevcut olduğunu göstermiş ve domuz parvovirusunun kalıtsal farklılaşmasını anlamamıza yardımcı olabilir.