Phylogenetic Analysis of Bovine Respiratory Syncytial Virus from Calves with Respiratory Disorders

Solunum Sistemi Hastalığı Olan Buzağılarda Saptanan Bovine Respiratory Syncytial Virusun Filogenetik Analizi

İlke KARAYEL HACIOĞLU,Nüvit COŞKUN,Selda DURAN YELKEN,Seçil SEVİNÇ,Feray ALKAN

Özet

Bovine respiratory disease (BRD) causes economic losses related to a reduction in weight gain of affected animals, veterinary treatment costs, death, etc. One of the important respiratory tract disease viruses is the bovine respiratory syncytial virus (BRSV). In this study, it is aimed to report the molecular characterization of detected BRSVs. Therefore, nasal samples from three calves in a herd seen severe respiratory disorders were examined for BRSV and other possible viral etiological agents by PCRs and the amplicons were sequenced. In the phylogenetic tree, BRSV circulating in this herd is clustered with the genetic subgroup III BRSVs deposited in GenBank from some other countries. This study on the molecular characterization of BRSV circulating in calves would contribute for future studies on the epidemiology of this infection and the development and/or choice the effective vaccines in Turkey.

Abstract

Sığırlarda solunum sistemi hastalıkları, etkilenen hayvanların kilo alımında azalma, veteriner tedavi masrafları, ölüm gibi sebeplerle ekonomik kayıplara neden olmaktadır. Bovine Respiratory Syncytial Virus (BRSV), solunum sistemini etkileyen viral etkenlerin başında gelmektedir. Bu çalışmada BRSV’nin saptanması ve tespit edilen etkenlerin moleküler karakterizasyonlarının ortaya konulması amaçlanmıştır. Bu amaçla, buzağılarda ağır solunum yolu sistemi bulguları gözlenen bir işletmedeki üç buzağıdan alınan burun akıntısı örnekleri BRSV ve diğer viral etkenler yönünden PCR ile test edilmiştir. RT-PCR sonucunda pozitif bulunan örneklerin dizin bilgileri elde edilmiştir. Yapılan filogenetik analiz sonucunda bu sürüde tespit edilen BRSV’nin genetik olarak subgrup III içerisinde yer aldığı ortaya konulmuştur. Buzağılarda saptanan BRSV’nin moleküler karakterizasyonu üzerine yapılan bu çalışma, bu enfeksiyonun epidemiyolojisi ve etkili aşıların geliştirilmesi ve/veya seçimiyle ilgili gelecekteki çalışmalara katkıda bulunacaktır.