Dergiler / Bezmiâlem Science / 2019 / Cilt: 7 - Sayı: 3
Karbapenem Dirençli Klebsiella pneumoniae Suşlarında Karbapenemaz Varlığının ve Klonal İlişkinin Araştırılması
- Dergi
- Bezmiâlem Science
- Sayfa
- 186–190
- DOI
- —
Özet
Amaç: Sağlıkla ilişki enfeksiyonlardan izole edilen dirençli Gram-negatif bakteriler dünya çapında sorun oluşturmaktadır. Özellikle genişlemiş spektrumlu beta laktamaz üreten Enterobacteriaceae ailesi bakterilerin neden olduğu enfeksiyon sıklığının giderek artması karbapenem grubu antibiyotiklerin daha fazla kullanılmasına ve bu antibiyotiklere karşı da direnç gelişmesine neden olmaktadır. Bu çalışmada, Klebsiella pneumoniae (K. pneumoniae) suşlarındaki karbapenem direnç oranları, mekanizmaları ve dirençli suşlar arasındaki klonal ilişki değerlendirilmeye çalışılmıştır. Yöntemler: Laboratuvarımıza gönderilen klinik örneklerden izole edilen karbapenem dirençli 91 K. pneumoniae suşu çalışmaya dahil edilmiştir. Bakterilerin tanımlanması Matris destekli lazer desorpsiyon iyonizasyonu (bioMérieux, Marcy-I’Étoile, Fransa) ile antimikrobiyal duyarlılığı VITEK-2 (bioMérieux) ile yapılmış, karbapenem direnci ertapenem E-test (bioMérieux) ile doğrulanmıştır. Karbapenemaz üretimine sebep olan genlerin (blaOXA-48, blaNDM-1, blaKPC, blaIMP, blaVIM-1) araştırılmasında gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu yöntemi kullanılmıştır. İzolatlar arasındaki klonal ilişki pulsed-field jel elektroforez ile araştırılmıştır. Bulgular: Karbapenem dirençli suşlarda blaOXA-48 pozitifliği %55, blaNDM-1 pozitifliği %37,4, blaKPC ve blaVIM-1 pozitifliği %1,1 olarak tespit edilmiştir. Toplam 10 suşta farklı direnç genlerinin birlikteliği tespit edilmiştir. Çalışmaya dahil edilen suşların 73’ünde klonal ilişkiye bakılmış olup 16 farklı grup saptanmıştır. Yirmi suş ise başka hiçbir suş ile klonal olarak ilişkili bulunmamıştır. Karbapenem direncine neden olan en yaygın direnç geni, Türkiye’de endemik olduğu bilinen blaOXA-48 geniydi. Sonuç: Sonuç olarak, çalışmamızda %3,13 olarak bulduğumuz karbapenem direnci ülkemizde henüz yüksek seviyede değildir. Ancak karbapenem direnç genlerinin suşlar arasında yayılabilmesi yakın bir gelecekte önemli bir sorun oluşturabilir. Moleküler yöntemler karbapenemaz tespitinde altın standarttır ama maliyeti yüksek olduğundan rutin olarak laboratuvarlarda kullanılamamaktadır. Modifiye Hodge testi ya da karbapenemaz inaktivasyon testi gibi daha az maliyetli testler karbapenemaz tespitinde alternatif testlerdir.
Abstract
Objective: Resistant Gram-negative bacteria isolated from health-related infections are a worldwide problem. Increasing frequency of infections particularly caused by Enterobacteriaceae producing expanded spectrum beta lactamase, leads to the use of more carbapenem group antibiotics which, in turn, leads to bacterial resistance. In this study, we aimed to evaluate carbapenem resistance in Klebsiella pneumoniae (K. pneumoniae) isolates, the mechanisms causing this resistance and the clonal relationship between these isolates. Methods: Ninety one K. pneumoniae strains isolated from clinical samples obtained in our laboratory were included to the study. The identification of the bacteria was performed with Matriks assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry (bioMérieux, Marcy-I’Étoile, France) and antimicrobial susceptibility with VITEK-2 (bioMérieux), and the carbapenem resistance was confirmed by ertapenem E-test (bioMérieux). Reverse transcription polymerase chain reaction method was used for the investigation of genes causing carbapenemase production (blaOXA-48, blaNDM-1, blaKPC, blaIMP, blaVIM-1). The clonal relationship between isolates was investigated by pulsed-field jel elektroforez. Results: In carbapenem resistant isolates, bla OXA-48 positivity was found to be 55%, blaNDM-1 positivity 37.4%, blaKPC and blaVIM-1 positivity 1.1%. A total of 10 isolates was identified with different resistance genes. In 73 of the isolates included in the study, the clonal relationship was examined, and 16 different groups were identified.