Karbapenem dirençli Klebsiella pneumoniae suşlarında OXA-48 ve KPC varlığının araştırılması

An Investigation on the Presence of OXA-48 and KPC in Carbapenem Resistant Klebsiella pneumoniae Strains

Özet

Son 10 yılda tüm dünyada karbapenem dirençli Enterobacteriaceae izolatlarında artış bildirilmektedir. Çalışmamızda Ocak 2011 ve Temmuz 2012 tarihleri arasında Sakarya Üniversitesi Hastanesinde saptanan karbapenem dirençli Klebsiella pneumoniae suşlarında OXA-48 ve KPC gen bölgelerinin araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya toplam 273 K.pneumoniae izolatı dahil edilmiştir. Tanımlama ve antibiyotik duyarlılık testleri konvansiyonel ve Vitek 2 otomatize sistemi ile gerçekleştirilmiştir. Karbapeneme dirençli saptanan iki izolat üç farklı primer seti ile 23S rRNA, OXA 48 ve KPC gen bölgeleri için araştırılmıştır. Laboratuvarımızda izole edilen karbapenem dirençli K.pneumoniae suşlarının küçük M tipi koloni morfolojileri, EMB agarda zayıf laktoz pozitiflikleri ve üreyi geç hidrolize etmeleri ile konvansiyonel çalışmalarda farklı algılara neden olabileceği gözlenmiştir. Otomatize sistemle K.pneumoniae olarak bildirilen izolatların tanımlaması 23S rRNA gen bölgelerinin gösterilmesiyle moleküler olarak doğrulanmıştır. Karbapenem direnciyle ilişkili olarak her iki suşunda OXA-48 gen bölgesine sahip olduğu gözlenmiştir. KPC gen bölgesiyle ilişkili pozitiflik saptanamamıştır. Sonuç olarak; mevcut veriler K.pneumoniae suşları arasında karbapenem direncinin sınırlı olduğunu göstermektedir. Ancak karbapeneme dirençli K.pneumoniae klinik önemi bütün dünyada artan bir konudur. Sonuçlarımız K.pneumoniae suşlarında direnç düzeyi ve mekanizmalarının izlenmesi ihtiyacına işaret etmektedir.

Abstract

Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae isolates increasingly have been reported worldwide in the past 10 years. In this study; we aimed to investigate OXA-48 and KPC gene regions of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae isolatesSakarya University Hospital, Sakarya between January 2011 and July 2012. A total of 273 K.pneumoniae isolates were included in this study. Identification and antibiotic susceptibility tests were performed with conventional and Vitek 2 automated system. Two carbapenem-resistant isolates screened using three different primers set to detect 23S rRNA, OXA-48 and KPC gene region. Carbapenem resistant K.pneumoniae isolates, isolated in our laboratory, have been observed that they could cause different perceptions during conventional studies due to their properties of having small M-type colony morphology, having weak positivity of lactose and having late urea hydrolysis. By demonstrating the 23S rRNA gene region of K.pneumoniae isolates where defined by automated system; it was accepted that the identification has been confirmed as molecular basis. It was obser- ved that both isolates had OXA-48 gene region in relation to carbapenem resistance. KPC gene regions were not positive in our isolates. In conclusion; available data concerning carbapenem resistance among K.pneumoniae strains are limited but these agents are a matter of increasing clinical concern worldwide. Our results highlighted the need to monitor resistance level and mechanisms among K.pneumoniae isolates. at